34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0189 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  100 
 
 		 589 aa  1191    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  67.88 
 
 		 558 aa  749    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  38.36 
 
 		 408 aa  207  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  37.2 
 
 		 978 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  36.92 
 
 		 1015 aa  189  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  34.6 
 
 		 377 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 559 aa  157  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  30.59 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 397 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  30.13 
 
 		 674 aa  124  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  30.53 
 
 		 949 aa  123  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  30.15 
 
 		 388 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  32.21 
 
 		 425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  29.61 
 
 		 526 aa  121  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  25.63 
 
 		 515 aa  111  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 523 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  32.36 
 
 		 391 aa  103  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  26.89 
 
 		 694 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  29.03 
 
 		 392 aa  97.8  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  26.18 
 
 		 399 aa  94  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  26.7 
 
 		 1173 aa  92  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 549 aa  90.9  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  27.46 
 
 		 543 aa  89.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  25.47 
 
 		 419 aa  89.4  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  30.19 
 
 		 509 aa  85.9  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  26.59 
 
 		 421 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  27.1 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  28.15 
 
 		 652 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  26.69 
 
 		 816 aa  68.6  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  27.31 
 
 		 382 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  26.91 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1381  neuraminidase  26.61 
 
 		 807 aa  54.7  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  22.01 
 
 		 371 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>