More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1519 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 198 aa  388  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1849  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.19 
 
 		 197 aa  263  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0165336  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1384  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.39 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2895  response regulator of salavaricin regulon  37.89 
 
 		 192 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0430888  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2959  salavaricin two-component response regulator  37.89 
 
 		 192 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681739  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1852  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.96 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000213283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.86 
 
 		 212 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.47 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  26.87 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 222 aa  99  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.62 
 
 		 222 aa  98.6  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.32 
 
 		 236 aa  98.2  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.24 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  32.5 
 
 		 200 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.56 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  30.1 
 
 		 216 aa  95.9  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.57 
 
 		 211 aa  95.9  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  29.21 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  28.08 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  27.62 
 
 		 211 aa  95.1  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 228 aa  94.7  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  27.4 
 
 		 213 aa  94.4  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.14 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4648  two component LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 242 aa  94  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  32 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.09 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.44 
 
 		 228 aa  93.2  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  31.5 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 242 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  27 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.82 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  30.84 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  30.84 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  30.84 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  30.84 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 216 aa  92.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  30.84 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0622  transcriptional regulator UhpA  29.85 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  30.37 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  30.37 
 
 		 215 aa  92  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  31.68 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17330  Two-component response regulator, LuxR family  24.15 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  31.5 
 
 		 200 aa  92  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  31.5 
 
 		 200 aa  92  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  31.5 
 
 		 200 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 200 aa  91.7  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0485  two component LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  31 
 
 		 200 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  26.6 
 
 		 227 aa  91.3  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.72 
 
 		 235 aa  91.3  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.31 
 
 		 224 aa  91.3  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.55 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 257 aa  90.5  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  31.5 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5261  competence protein A  28.37 
 
 		 213 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  26.17 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  26.03 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  31.5 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0081  two component LuxR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.57 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.76 
 
 		 216 aa  89.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  27.5 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  29.91 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  26.79 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  29.67 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.87 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.46 
 
 		 225 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1698  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.1 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.49 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.37 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  28.93 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.22 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4080  transcriptional regulatory protein UhpA  28.93 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 215 aa  88.6  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  32.67 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.24 
 
 		 227 aa  88.2  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  28.37 
 
 		 234 aa  88.6  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.92 
 
 		 213 aa  88.2  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.15 
 
 		 225 aa  88.2  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>