More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1100 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1100  citrate synthase  100 
 
 		 450 aa  908    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2571  citrate synthase  54.22 
 
 		 450 aa  503  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000324243  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1122  citrate synthase  53.85 
 
 		 448 aa  478  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3027  citrate synthase  52.09 
 
 		 456 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000187967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0903  citrate synthase  51.73 
 
 		 455 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2155  Citrate (Si)-synthase  51.25 
 
 		 441 aa  458  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1989  citrate synthase  50.57 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000399461  normal  0.147998 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3834  citrate synthase  49.31 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000081885  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2696  Citrate (Si)-synthase  47.45 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0085  citrate synthase  44.91 
 
 		 448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.691353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12790  citrate synthase  44.94 
 
 		 451 aa  395  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0027871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28210  citrate synthase  44.32 
 
 		 445 aa  393  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0102554  normal  0.648823 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.79 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.81 
 
 		 377 aa  190  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.56 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.42 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.01 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.41 
 
 		 382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.86 
 
 		 382 aa  179  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  34.79 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  34.79 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  33.33 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  32.94 
 
 		 373 aa  176  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32 
 
 		 378 aa  176  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.1 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.91 
 
 		 378 aa  175  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  32.76 
 
 		 378 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  34.11 
 
 		 386 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  32.38 
 
 		 371 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.83 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  31.34 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  31.34 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  32.11 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  32.11 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  32.11 
 
 		 371 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02719  methylcitrate synthase  31.52 
 
 		 384 aa  171  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  32.11 
 
 		 371 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  32.11 
 
 		 371 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  32.11 
 
 		 371 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0663  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.23 
 
 		 373 aa  170  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.280152  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  32.38 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  31.46 
 
 		 381 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  30.1 
 
 		 370 aa  169  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4790  methylcitrate synthase  31.36 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  32.11 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  31.69 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  31.23 
 
 		 371 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  31.31 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  32.8 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  32.73 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2251  citrate synthase I  32.14 
 
 		 434 aa  167  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  31.31 
 
 		 381 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1586  methylcitrate synthase  31.7 
 
 		 385 aa  167  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000154256  normal  0.49975 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  33.33 
 
 		 391 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.29 
 
 		 380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  31.85 
 
 		 371 aa  166  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  31.94 
 
 		 430 aa  166  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23220  methylcitrate synthase  30.55 
 
 		 387 aa  166  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.95 
 
 		 430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  32.31 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  31.89 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0463  methylcitrate synthase  30.69 
 
 		 389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000165686  hitchhiker  0.000000131062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0401  methylcitrate synthase  30.69 
 
 		 389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.600733  hitchhiker  0.00000000076827 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1347  methylcitrate synthase  30.38 
 
 		 389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  31.39 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  31.99 
 
 		 383 aa  164  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1635  methylcitrate synthase  29.93 
 
 		 386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.169583 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2079  methylcitrate synthase  29.93 
 
 		 386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.340874  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4451  methylcitrate synthase  30.81 
 
 		 384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230042  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  33.17 
 
 		 443 aa  163  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  31.8 
 
 		 431 aa  163  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2081  methylcitrate synthase  30.31 
 
 		 404 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847456  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.14 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3029  methylcitrate synthase  30.65 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  30.65 
 
 		 378 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  31.45 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0888  citrate synthase  32.04 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.631219  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0421  methylcitrate synthase  30.89 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0258062 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  31.78 
 
 		 428 aa  161  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  32.72 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0403  methylcitrate synthase  30.89 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  31.95 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0409  methylcitrate synthase  30.89 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027346 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  31.04 
 
 		 397 aa  160  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.57 
 
 		 404 aa  160  5e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2329  methylcitrate synthase  30.21 
 
 		 393 aa  160  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  31.16 
 
 		 375 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  31.25 
 
 		 355 aa  159  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2422  type II citrate synthase  32.45 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  31.76 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2165  type II citrate synthase  31.53 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.962895  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  32.25 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  31.42 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  31.46 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  31.76 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  30.41 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0357  methylcitrate synthase  29.67 
 
 		 389 aa  157  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1198  methylcitrate synthase  28.82 
 
 		 376 aa  157  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0404  methylcitrate synthase  29.67 
 
 		 389 aa  157  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0398  methylcitrate synthase  29.67 
 
 		 389 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>