43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1237 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  100 
 
 
689 aa  1381    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  31.42 
 
 
752 aa  194  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4108  Parallel beta-helix repeat protein  24.22 
 
 
721 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5049  hypothetical protein  29.34 
 
 
679 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326897  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4356  hypothetical protein  29.53 
 
 
688 aa  105  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4588  hypothetical protein  32.32 
 
 
692 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  24.87 
 
 
951 aa  90.9  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.51 
 
 
789 aa  90.9  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  25.12 
 
 
1121 aa  84  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  25.52 
 
 
838 aa  83.2  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  23.76 
 
 
2286 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  39.32 
 
 
965 aa  79  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  22.63 
 
 
1024 aa  76.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  24.01 
 
 
708 aa  71.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  24.51 
 
 
709 aa  71.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.62 
 
 
644 aa  64.7  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  26.49 
 
 
1049 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  40.19 
 
 
547 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  38.89 
 
 
627 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  37 
 
 
410 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2876  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.04 
 
 
512 aa  58.9  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  36.78 
 
 
832 aa  57.4  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1931  Pectate lyase  33.33 
 
 
458 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.24321  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5426  hypothetical protein  46.05 
 
 
563 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4387  hypothetical protein  32.1 
 
 
502 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  32.92 
 
 
839 aa  55.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0539  hypothetical protein  42.31 
 
 
648 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280042  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  37.63 
 
 
722 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  23.41 
 
 
677 aa  51.6  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  21.31 
 
 
1206 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  33.62 
 
 
801 aa  50.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1282  hypothetical protein  35.42 
 
 
481 aa  50.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  35.29 
 
 
750 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3056  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.48 
 
 
694 aa  48.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1855  Pectate disaccharide-lyase  34.18 
 
 
653 aa  48.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0662  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.28 
 
 
500 aa  47.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000522571  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2340  hypothetical protein  23.24 
 
 
898 aa  47  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  33.77 
 
 
791 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0852  pectate lyase  33.33 
 
 
415 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  30.15 
 
 
437 aa  44.7  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2919  hypothetical protein  30.36 
 
 
338 aa  44.3  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000462284  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  37.18 
 
 
1011 aa  44.3  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  23.96 
 
 
1236 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>