96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2004 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  100 
 
 
125 aa  254  3e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  34.86 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  30.28 
 
 
123 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  34.55 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  29.17 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  29.17 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  29.17 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  29.17 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  38 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  33.68 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  28.83 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  30.7 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  33.64 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  27.62 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  38.2 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2568  hypothetical protein  37.37 
 
 
109 aa  53.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000926681  normal  0.0635574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  29.66 
 
 
200 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3455  hypothetical protein  36.99 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  30.36 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  28.85 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  30.25 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  28.85 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  36.96 
 
 
146 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  35.48 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  37.62 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  33.33 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  33.33 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  33.33 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2604  hypothetical protein  27.5 
 
 
133 aa  50.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462072 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  33.33 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  33.33 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  33.33 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  30.7 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  35.23 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  28.45 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  32.48 
 
 
143 aa  50.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  29.51 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  31.68 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  35.71 
 
 
393 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  32.5 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  32.58 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  32.63 
 
 
179 aa  49.7  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  28.72 
 
 
386 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0430  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 
230 aa  49.7  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  28.7 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  28.7 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  39.39 
 
 
174 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0175  hypothetical protein  31.31 
 
 
214 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  29.2 
 
 
134 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4038  hypothetical protein  31.71 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  32.41 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  35.35 
 
 
166 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  31.65 
 
 
114 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4184  protein of unknown function DUF805  31.21 
 
 
173 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.150084  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  33.71 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  37.21 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  31.58 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  31.58 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  31.58 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  28.8 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1868  protein of unknown function DUF805  28.89 
 
 
188 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2214  hypothetical protein  28.89 
 
 
188 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  29.09 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  29.09 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0841771 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  29.09 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  29.09 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  29.09 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  29.09 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0388  hypothetical protein  25.86 
 
 
122 aa  43.5  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117368  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  36.79 
 
 
318 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  29.9 
 
 
1123 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  36.07 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2214  protein of unknown function DUF805  30 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03806  conserved inner membrane protein  28.4 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4064  protein of unknown function DUF805  28.4 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0415  hypothetical protein  43.18 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03755  hypothetical protein  28.4 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2367  hypothetical protein  29.79 
 
 
206 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2412  hypothetical protein  29.79 
 
 
206 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5376  hypothetical protein  28.4 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4455  hypothetical protein  28.4 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4097  hypothetical protein  28.4 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4361  hypothetical protein  28.4 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.375451 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2197  protein of unknown function DUF805  35.23 
 
 
346 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4401  hypothetical protein  28.4 
 
 
129 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20900  predicted membrane protein  30.85 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.761588  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2546  hypothetical protein  30.28 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2599  protein of unknown function DUF805  32.5 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  33.62 
 
 
286 aa  40.8  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3557  hypothetical protein  31.17 
 
 
121 aa  40.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  28.95 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  25.26 
 
 
168 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4152  hypothetical protein  27.16 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>