95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4980 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  100 
 
 		 1123 aa  2283    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2000  hypothetical protein  37.64 
 
 		 797 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5416  hypothetical protein  34.72 
 
 		 747 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2541  hypothetical protein  33.33 
 
 		 750 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28820  hypothetical protein  33.52 
 
 		 832 aa  319  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778693  decreased coverage  0.00000000161145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3424  hypothetical protein  32.85 
 
 		 828 aa  308  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.827282  normal  0.753977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2859  hypothetical protein  32.78 
 
 		 866 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5143  hypothetical protein  31.79 
 
 		 798 aa  298  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09812 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0221  plasma membrane H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  30.77 
 
 		 845 aa  296  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.927678  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.71 
 
 		 1344 aa  295  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1245  hypothetical protein  30.01 
 
 		 820 aa  293  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.162309999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4431  hypothetical protein  31.38 
 
 		 954 aa  289  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0139  hypothetical protein  30.35 
 
 		 812 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8550  hypothetical protein  31.36 
 
 		 728 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128819  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1169  hypothetical protein  29.11 
 
 		 782 aa  239  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1947  hypothetical protein  29.44 
 
 		 777 aa  225  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231119  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1836  hypothetical protein  28.35 
 
 		 798 aa  222  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2290  hypothetical protein  29.28 
 
 		 798 aa  221  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.947469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4154  hypothetical protein  33.76 
 
 		 643 aa  207  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1078  hypothetical protein  27.81 
 
 		 735 aa  159  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2561  hypothetical protein  28.31 
 
 		 867 aa  140  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00089878  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0328  hypothetical protein  26.69 
 
 		 726 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  40.14 
 
 		 156 aa  89.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0063  hypothetical protein  31.69 
 
 		 1356 aa  77.4  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.80787  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  35.07 
 
 		 120 aa  75.5  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  36.81 
 
 		 138 aa  70.5  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  64.7  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  64.7  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  64.7  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  32.59 
 
 		 123 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  31.82 
 
 		 146 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2214  protein of unknown function DUF805  31.37 
 
 		 215 aa  60.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  35.11 
 
 		 123 aa  58.9  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  31.39 
 
 		 118 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  31.39 
 
 		 118 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  31.39 
 
 		 122 aa  57.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 		 155 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  32.33 
 
 		 123 aa  56.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  32.32 
 
 		 116 aa  55.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  43.18 
 
 		 131 aa  55.1  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  28.16 
 
 		 179 aa  54.7  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  30.07 
 
 		 128 aa  54.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  30.07 
 
 		 121 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  30.07 
 
 		 121 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  30.07 
 
 		 121 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  30.07 
 
 		 121 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  30.07 
 
 		 128 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  36.78 
 
 		 393 aa  54.7  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  30.07 
 
 		 121 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  30.07 
 
 		 121 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  30.07 
 
 		 128 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  29.5 
 
 		 118 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  34.69 
 
 		 116 aa  53.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  26.67 
 
 		 125 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  29.5 
 
 		 118 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  29.5 
 
 		 118 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  29.5 
 
 		 118 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  29.5 
 
 		 118 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  34.74 
 
 		 121 aa  53.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  29.5 
 
 		 118 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  31.39 
 
 		 153 aa  52.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  31.39 
 
 		 144 aa  52.8  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  26.12 
 
 		 123 aa  53.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  36.15 
 
 		 126 aa  50.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  31.88 
 
 		 134 aa  50.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  37.08 
 
 		 112 aa  50.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  35.38 
 
 		 126 aa  50.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  37.21 
 
 		 174 aa  50.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0427  hypothetical protein  34.69 
 
 		 117 aa  49.3  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.082341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  32.11 
 
 		 127 aa  48.5  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0171  protein of unknown function DUF805  27.94 
 
 		 140 aa  48.5  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  26.92 
 
 		 146 aa  48.5  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  34.09 
 
 		 114 aa  48.5  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  34.07 
 
 		 115 aa  48.5  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  30.46 
 
 		 193 aa  48.1  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  29.71 
 
 		 141 aa  47.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  32.28 
 
 		 113 aa  46.6  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0175  hypothetical protein  28.46 
 
 		 214 aa  45.8  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  35.71 
 
 		 68 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1521  hypothetical protein  28.41 
 
 		 100 aa  45.8  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0995988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3422  inner membrane protein YhaH  33.7 
 
 		 121 aa  45.8  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3425  inner membrane protein YhaH  33.7 
 
 		 121 aa  45.8  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0469756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3529  hypothetical protein  33.7 
 
 		 121 aa  45.8  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.891346  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3495  inner membrane protein YhaH  33.7 
 
 		 121 aa  45.8  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  45.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5376  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  45.1  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  45.1  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375451 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  28.89 
 
 		 141 aa  45.1  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4097  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  45.1  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03755  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  45.1  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4064  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 		 146 aa  45.1  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03806  conserved inner membrane protein  33.33 
 
 		 146 aa  45.1  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4455  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  45.1  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4152  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  44.7  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4038  hypothetical protein  32.56 
 
 		 112 aa  44.7  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>