92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3187 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  100 
 
 
134 aa  268  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  36.64 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  40.46 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  35.34 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  34.92 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  29.51 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  39.52 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  37.29 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  37.29 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  34.65 
 
 
166 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  29.66 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  29.27 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  29.27 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  29.27 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  29.27 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  29.27 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  29.27 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  29.06 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  30.33 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  29.06 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  30.16 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  30.16 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  30.16 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  27.94 
 
 
127 aa  57.8  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  31.36 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  34.19 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  30.33 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  31.54 
 
 
193 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  28.46 
 
 
221 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  27.05 
 
 
112 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  27.64 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  33.9 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  24 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  24 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  24 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  24 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  29.46 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  29.46 
 
 
128 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  29.46 
 
 
128 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  29.46 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  29.46 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  29.46 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  29.46 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  29.46 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  29.46 
 
 
128 aa  54.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  29.51 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  47.17 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  33.08 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  32.79 
 
 
168 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  30.6 
 
 
200 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  31.88 
 
 
1123 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  32.63 
 
 
393 aa  50.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2604  hypothetical protein  45.61 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4038  hypothetical protein  29.13 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511833  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0427  hypothetical protein  30.33 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.082341  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  29.6 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  30.65 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  38.24 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  31.5 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0701  protein of unknown function DUF805  37.33 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  27.87 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  29.2 
 
 
125 aa  48.9  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  36.05 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  33.05 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0829  hypothetical protein  28.15 
 
 
194 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  27.08 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  29.69 
 
 
174 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3455  hypothetical protein  30.25 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  30.17 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  29.75 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  28.33 
 
 
121 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  30.39 
 
 
179 aa  47.4  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  27.63 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2599  protein of unknown function DUF805  30.21 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0415  hypothetical protein  31.34 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  29.66 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2214  protein of unknown function DUF805  31.91 
 
 
215 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4184  protein of unknown function DUF805  32.67 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.150084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  31.67 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  31.58 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1482  protein of unknown function DUF805  34.43 
 
 
371 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.118245  normal  0.324958 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0171  protein of unknown function DUF805  26.76 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  27.46 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0656  hypothetical protein  27.64 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00883836  decreased coverage  0.00160249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  27.78 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  31.91 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  41.18 
 
 
318 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  31.46 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  39.13 
 
 
355 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  24.17 
 
 
386 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  39.13 
 
 
360 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1841  protein of unknown function DUF805  30.93 
 
 
153 aa  40  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>