73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3455 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3455  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  310  4.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  42.5 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  38.71 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  34.69 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  33.67 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  38.2 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  35.8 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2568  hypothetical protein  45.56 
 
 
109 aa  61.2  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000926681  normal  0.0635574 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  34.07 
 
 
123 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0829  hypothetical protein  25.4 
 
 
194 aa  57.8  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  36.05 
 
 
393 aa  57.4  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  36.26 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  33.66 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  31.73 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  41.25 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  39.47 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0656  hypothetical protein  40.45 
 
 
109 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00883836  decreased coverage  0.00160249 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  32.29 
 
 
116 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  38.16 
 
 
115 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  39.08 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  31.52 
 
 
136 aa  54.3  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  54.3  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  34.83 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  37.04 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4038  hypothetical protein  38.16 
 
 
112 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511833  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  36.99 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  32.65 
 
 
120 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  32.18 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  36.27 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1841  protein of unknown function DUF805  35.64 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2214  protein of unknown function DUF805  35 
 
 
215 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  33.01 
 
 
123 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  36.05 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  35.9 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  37.63 
 
 
126 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  35.9 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  35.9 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  35.9 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  35.16 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  36.73 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  36.73 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  39.77 
 
 
122 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  36.73 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  39.77 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  36.73 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  36.73 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  39.77 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  36.73 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4184  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.150084  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  31.73 
 
 
121 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20900  predicted membrane protein  35.05 
 
 
137 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.761588  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  32.53 
 
 
131 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  37.93 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  36.54 
 
 
174 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  30.25 
 
 
134 aa  47.4  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0427  hypothetical protein  35.71 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.082341  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  33.03 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1966  protein of unknown function DUF805  37.76 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  29.89 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  29.89 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  26.26 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1482  protein of unknown function DUF805  34.07 
 
 
371 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.118245  normal  0.324958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  31.97 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0450  protein of unknown function DUF805  38.71 
 
 
210 aa  44.7  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.621893  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2214  hypothetical protein  28.65 
 
 
188 aa  44.3  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573949  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1868  protein of unknown function DUF805  28.65 
 
 
188 aa  44.3  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  28.76 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2599  protein of unknown function DUF805  35.62 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  26.49 
 
 
200 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21090  predicted membrane protein  31.48 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2604  hypothetical protein  36.47 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462072 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0175  hypothetical protein  34.12 
 
 
214 aa  40.8  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  35.29 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>