36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0388 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0388  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  246  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117368  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0068  hypothetical protein  42.74 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.410324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  33.61 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  31.19 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  29.2 
 
 		 221 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  34.21 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  31.67 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  34.62 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  29.53 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  34.62 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  25.86 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  29.57 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  29.57 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  29.57 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0415  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  27.97 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  30.56 
 
 		 318 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  26.32 
 
 		 118 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  26.32 
 
 		 118 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  26.32 
 
 		 118 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  26.32 
 
 		 118 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5221  hypothetical protein  32.28 
 
 		 133 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170062  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  26.32 
 
 		 118 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  26.32 
 
 		 118 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  25.23 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  25.23 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  25.23 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  25.23 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  25.23 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  25.23 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  25.23 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  25.23 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  25.23 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  28.1 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  27.01 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  34.04 
 
 		 123 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>