More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0667 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0667  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 		 202 aa  416  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2681  isopropylmalate isomerase small subunit  54.77 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1847  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  51.27 
 
 		 201 aa  222  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1602  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.74 
 
 		 201 aa  217  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0187865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3629  isopropylmalate isomerase small subunit  44.95 
 
 		 206 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3761  isopropylmalate isomerase small subunit  44.72 
 
 		 197 aa  185  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3810  isopropylmalate isomerase small subunit  44.72 
 
 		 197 aa  185  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0321  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.97 
 
 		 203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00352929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1327  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.24 
 
 		 197 aa  177  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.507856  normal  0.452578 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0871  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.88 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0643  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.49 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02881  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  44.33 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.130398  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5027  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  41.62 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3966  isopropylmalate isomerase small subunit  42.13 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.0175805 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.88 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.420219  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02771  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  43.3 
 
 		 207 aa  167  7e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.385201  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2087  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  43.46 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.58 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2548  isopropylmalate isomerase small subunit  43.08 
 
 		 202 aa  164  5.9999999999999996e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0488432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0900  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.2 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24681  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  41.58 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2764  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.92 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1545  aconitate hydratase domain protein  42.63 
 
 		 209 aa  153  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.831045  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1621  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  39.69 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2657  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.58 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03331  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  39.18 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02781  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  40.41 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02811  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  39.38 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  34.52 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  36.55 
 
 		 200 aa  124  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  36.36 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  36.04 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  34.85 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  36.41 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  36.04 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  35.9 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  35.35 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  38.34 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  37.14 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  35.38 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  35.38 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  35.03 
 
 		 200 aa  118  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  35.9 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  35.9 
 
 		 201 aa  118  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  37.06 
 
 		 201 aa  117  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  34.52 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  36.63 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  35.9 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  37.21 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  43.59 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  37.21 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  37.21 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  37.21 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  36.22 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  37.11 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  36.41 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  36.41 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  36.41 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  36.92 
 
 		 201 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  36.92 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  36.92 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  36.92 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  36.92 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  36.92 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  36.92 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2730  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  34.9 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  36.92 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  36.92 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  35.18 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6957  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  34.92 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  42.95 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  35.18 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  35.23 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3743  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35.44 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  34.67 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  37.42 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1295  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  36.69 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  36.41 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  32.49 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  32.49 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0863  isopropylmalate isomerase small subunit  33.17 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000359889  hitchhiker  0.000927879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3271  isopropylmalate isomerase small subunit  35.23 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  32.49 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1246  isopropylmalate isomerase small subunit  40.51 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  33.33 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  34.54 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  33.5 
 
 		 214 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  33.85 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  35.26 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  31.63 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  32.49 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  35.26 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  33.84 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  33.33 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  33.84 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0215  isopropylmalate isomerase small subunit  36.08 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20437 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  35.35 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  37.01 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  33.99 
 
 		 217 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  35.8 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>