81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5383 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 93 aa  167  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  75.27 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0925  PAAR repeat-containing protein  63.83 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  53.26 
 
 		 92 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  54.35 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  54.37 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  49.51 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  53.4 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  49 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  43.01 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  42.55 
 
 		 540 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  51.9 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  49.46 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  53.85 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  43.4 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  43.01 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  46.6 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2946  PAAR repeat-containing protein  44.57 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  44.86 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  44.68 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  46.23 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0768  hypothetical protein  41.05 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  49.49 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  40 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  42.42 
 
 		 592 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  50 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  53.73 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  43.4 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  40.4 
 
 		 456 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6683  PAAR repeat-containing protein  38.04 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  35.23 
 
 		 1229 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3018  PAAR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.820198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 456 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  40.4 
 
 		 461 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  41.41 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0167  Rhs family protein  42.86 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.688933  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0130  Rhs family protein  42.86 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904339  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  40.54 
 
 		 855 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1614  Rhs family protein  42.86 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0144  PAAR motif-containing protein  42.86 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.352766  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  39.19 
 
 		 1379 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  37.78 
 
 		 1381 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  39.47 
 
 		 406 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  46.58 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2253  PAAR repeat-containing protein  52 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175584  hitchhiker  0.000480373 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  37.78 
 
 		 1541 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  37.78 
 
 		 1541 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  37.78 
 
 		 1541 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  37.78 
 
 		 1541 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  37.78 
 
 		 1541 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  37.78 
 
 		 1541 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  38.78 
 
 		 481 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  37.35 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1386 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  45.83 
 
 		 386 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  39.44 
 
 		 1140 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1680  PAAR repeat-containing protein  61.36 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0483  PAAR repeat-containing protein  36.47 
 
 		 597 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  36.67 
 
 		 1553 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2551  PAAR repeat-containing protein  59.09 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1375  hypothetical protein  34.78 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1933  hypothetical protein  34.78 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.437676  normal  0.622076 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1487  hypothetical protein  34.78 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  39.24 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  35.42 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  34.02 
 
 		 469 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  33.75 
 
 		 1604 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  39.58 
 
 		 174 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1578  Rhs family protein  36.59 
 
 		 1556 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883586  normal  0.184607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  35.05 
 
 		 177 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  42.35 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  39.74 
 
 		 453 aa  40.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  41.56 
 
 		 188 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  39.6 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  39.6 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  42.22 
 
 		 1411 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  45.21 
 
 		 323 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>