245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3497 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3497  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 227 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0439  MerR family transcriptional regulator  57.71 
 
 		 228 aa  223  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5056  putative transcriptional regulator, MerR family  54.82 
 
 		 227 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.589555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1948  transcriptional regulator, MerR family  46.56 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566007  hitchhiker  0.00390596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2421  MerR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0993046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2297  regulatory protein, MerR  46.26 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1167  transcriptional regulator, MerR family  46.26 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6176  transcriptional regulator, MerR family  48.76 
 
 		 244 aa  165  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5846  transcriptional regulator, MerR family  47.11 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1715  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.382422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1011  transcriptional regulator, MerR family  39.64 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1563  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  0.968218 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5382  transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3253  transcriptional regulator, MerR family  34.12 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000117096  decreased coverage  0.00000535061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1320  transcriptional regulator, MerR family  32.61 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1516  transcriptional regulator, MerR family  26.74 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3149  transcriptional regulator, MerR family  26.21 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 141 aa  52.8  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 283 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 352 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01300  predicted transcriptional regulator  31.18 
 
 		 104 aa  52.4  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 158 aa  52  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 361 aa  52  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1372  putative transcriptional regulator  40.26 
 
 		 282 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0122562  hitchhiker  0.0000765424 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1387  putative transcriptional regulator  40.26 
 
 		 282 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00489991  normal  0.361581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 366 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1914  putative transcriptional regulator  40.26 
 
 		 282 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000412659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 345 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2095  putative transcriptional regulator  40.26 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000221737  hitchhiker  0.000000256129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 117 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  32.91 
 
 		 342 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 119 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4449  MerR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1356  putative transcriptional regulator  38.96 
 
 		 282 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000135283  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 		 274 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  37.88 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  37.88 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 299 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  35.82 
 
 		 132 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  38.37 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 335 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  40 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0435  putative transcriptional regulator, MerR family  39.29 
 
 		 165 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.517587  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 337 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  25.45 
 
 		 269 aa  48.9  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  35.38 
 
 		 243 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.38 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  35.38 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  35.38 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  41.79 
 
 		 346 aa  48.5  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  35.38 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  35.38 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0740  MerR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 299 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0768  MerR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 299 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.819465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 144 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  35.19 
 
 		 137 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 282 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 151 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  39.39 
 
 		 129 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 133 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 134 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 160 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  28.7 
 
 		 125 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 351 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 351 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  43.75 
 
 		 369 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 340 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 123 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4804  MerR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 341 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2513  transcriptional regulator, MerR family  32.29 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  39.58 
 
 		 132 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  48.84 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  37.5 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 179 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 153 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 135 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 135 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 135 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 135 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 135 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 135 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 135 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3763  transcriptional regulator, MerR family  30.51 
 
 		 132 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503955  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  45.1 
 
 		 133 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 135 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 135 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 135 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 135 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>