18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01300 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01300  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  212  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5846  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 245 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1948  transcriptional regulator, MerR family  33.71 
 
 		 273 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566007  hitchhiker  0.00390596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  38.18 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1167  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 235 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3497  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 227 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 340 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3072  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 341 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 351 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 351 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0439  MerR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0139  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5056  putative transcriptional regulator, MerR family  29.79 
 
 		 227 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.589555 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  27.27 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2331  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00979491  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5066  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 340 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 273 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>