105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1733 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1733  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
251 aa  485  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2175  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.823265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  39.47 
 
 
277 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  37.84 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  32.43 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
275 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  37.39 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
295 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  31.71 
 
 
295 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  31.08 
 
 
324 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
279 aa  48.5  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  48 
 
 
277 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4287  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0341  alpha/beta hydrolase fold protein  38.83 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  35.24 
 
 
271 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  34.74 
 
 
340 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 
261 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1877  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 
310 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175585  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
294 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
289 aa  45.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 
282 aa  45.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.84 
 
 
310 aa  45.8  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
299 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 
288 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 
275 aa  45.8  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
340 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  20.17 
 
 
310 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  37.63 
 
 
350 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
421 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  22.27 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8363  hypothetical protein  38.66 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  26.02 
 
 
299 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0164  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  30.91 
 
 
311 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 
340 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  33.68 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 
291 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  27.31 
 
 
2762 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0328  alpha/beta hydrolase fold protein  36.9 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 
350 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  35.78 
 
 
308 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  30.68 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1914  alpha/beta fold family hydrolase  28.08 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
288 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
288 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0163  hypothetical protein  37.65 
 
 
284 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3034  alpha/beta hydrolase fold  40.43 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5301  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
275 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0411454  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
288 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
288 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  42.27 
 
 
366 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1666  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
338 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.993525 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 
291 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  30.93 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  25.87 
 
 
279 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
288 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
275 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  35.85 
 
 
301 aa  43.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
304 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 
364 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
288 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  25.91 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
291 aa  42.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 
267 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  25.87 
 
 
279 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  25.87 
 
 
279 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7125  putative epoxide hydrolase  33.01 
 
 
356 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2119  hypothetical protein  30.63 
 
 
314 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.48644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 
281 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  32.77 
 
 
279 aa  42.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
306 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 
260 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  35.05 
 
 
252 aa  42.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  29.55 
 
 
301 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  29.55 
 
 
301 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 
250 aa  42.4  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11931  Alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 
299 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  29.55 
 
 
301 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  29.36 
 
 
288 aa  42  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
295 aa  42  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  29.55 
 
 
303 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  27.68 
 
 
285 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>