237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1441 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  100 
 
 		 235 aa  450  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  54.46 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  50.43 
 
 		 237 aa  185  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  51.21 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  48.71 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  50.24 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  47.44 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  47.44 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  47.51 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  51.18 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  48.54 
 
 		 238 aa  168  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  46.58 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  47.64 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  47.57 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  47.57 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  48.04 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.49 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.54 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  47.34 
 
 		 231 aa  158  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  47.71 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  47.48 
 
 		 247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.28 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  37.39 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.07 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  36.19 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.05 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  39.32 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.18 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.04 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  36.02 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  36.02 
 
 		 243 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.87 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.28 
 
 		 254 aa  121  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.86 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  39.83 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  31.73 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  32.29 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  39.67 
 
 		 250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  36.06 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.82 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  38.7 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  34.76 
 
 		 262 aa  111  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  32.68 
 
 		 262 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  30.8 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.91 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  34.45 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  32.62 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  32.62 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  33.5 
 
 		 235 aa  108  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  31.22 
 
 		 227 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  33.19 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.64 
 
 		 255 aa  105  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  37.75 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  38.68 
 
 		 744 aa  105  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  32.5 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  34.27 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  31.43 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.6 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.6 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  31.1 
 
 		 270 aa  102  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  29.31 
 
 		 243 aa  95.9  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  31.9 
 
 		 264 aa  95.9  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  38.27 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  29.81 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0078  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.98 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  38.32 
 
 		 500 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3563  cobyric acid synthase  38.41 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.637799  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  38.32 
 
 		 500 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0766  cobyric acid synthase  36.57 
 
 		 498 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  29.93 
 
 		 505 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1326  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  24.42 
 
 		 248 aa  62  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000536393  hitchhiker  0.000591695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  35.76 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0183  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.79 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.689135  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  37.2 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  34.52 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0247  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.95 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  30.82 
 
 		 501 aa  59.3  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  34.81 
 
 		 485 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  30.63 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  34.09 
 
 		 518 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  36.6 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  30.72 
 
 		 863 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  33.79 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  34.45 
 
 		 485 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  28.46 
 
 		 465 aa  55.5  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  34.38 
 
 		 493 aa  55.1  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  30 
 
 		 494 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  33.87 
 
 		 491 aa  54.3  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3196  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.98 
 
 		 475 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  30.41 
 
 		 776 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  29.93 
 
 		 787 aa  52.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  26.12 
 
 		 507 aa  52.8  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  26.32 
 
 		 492 aa  52.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  33.77 
 
 		 532 aa  52.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3550  cobyric acid synthase  32.74 
 
 		 513 aa  52  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0036  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.2 
 
 		 460 aa  52  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1596  cobyric acid synthase  31.14 
 
 		 496 aa  52  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.928807  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  26.09 
 
 		 509 aa  51.6  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  34.36 
 
 		 484 aa  52  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0262  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.48 
 
 		 489 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>