More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0780 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0780  inner-membrane translocator  100 
 
 		 292 aa  557  1e-158  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2204  inner-membrane translocator  49.31 
 
 		 293 aa  248  7e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  32.4 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5536  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898761  hitchhiker  0.00000762258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 534 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7434  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  32.04 
 
 		 287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  29.55 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 551 aa  119  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3243  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.577561  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 288 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  32.2 
 
 		 288 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4451  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8052  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.79 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.39 
 
 		 298 aa  115  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  29.68 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  33.45 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.68 
 
 		 523 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619152  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.98 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4190  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.88 
 
 		 537 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.1 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 652 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.51 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1795  inner-membrane translocator  34.16 
 
 		 542 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.526146  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  33.33 
 
 		 542 aa  109  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  29.58 
 
 		 338 aa  108  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  28.91 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3509  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 542 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.29 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 540 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  29.55 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4909  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 		 287 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.54 
 
 		 290 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7017  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.45 
 
 		 520 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.470774 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6434  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.263735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  29.28 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  29.21 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.21 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 537 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.21 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.21 
 
 		 656 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.86 
 
 		 558 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4378  inner-membrane translocator  32 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.55 
 
 		 545 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.03 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0802  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.37 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  28.93 
 
 		 603 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  28.93 
 
 		 603 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  28.93 
 
 		 603 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.93 
 
 		 603 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3519  inner-membrane translocator  32.55 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186489  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>