More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3354 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  82.01 
 
 
430 aa  707    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  100 
 
 
429 aa  837    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  96.97 
 
 
429 aa  818    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  97.2 
 
 
429 aa  820    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  37.3 
 
 
435 aa  274  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  35.43 
 
 
435 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  35.75 
 
 
439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  32.09 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  34.41 
 
 
431 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  33.26 
 
 
433 aa  245  9e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  34.5 
 
 
448 aa  230  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  35.89 
 
 
428 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  30.37 
 
 
437 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  36.45 
 
 
435 aa  222  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  36.27 
 
 
435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  31.87 
 
 
428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  33.41 
 
 
428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  33.72 
 
 
429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  29.23 
 
 
443 aa  209  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  34.13 
 
 
425 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  33.26 
 
 
438 aa  206  8e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  30.3 
 
 
440 aa  206  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  33.98 
 
 
427 aa  206  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  34.93 
 
 
428 aa  206  9e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  34.13 
 
 
446 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  31.7 
 
 
435 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  33.81 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  33.81 
 
 
425 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  33.81 
 
 
425 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  33.81 
 
 
425 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  33.81 
 
 
425 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  33.81 
 
 
425 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  33.81 
 
 
425 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  35.8 
 
 
432 aa  200  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  33.81 
 
 
425 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  33.81 
 
 
425 aa  199  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  31.9 
 
 
437 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  29.19 
 
 
433 aa  194  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  31.03 
 
 
442 aa  192  7e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  31.85 
 
 
426 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  29.09 
 
 
433 aa  190  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  29.09 
 
 
433 aa  190  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  34.62 
 
 
446 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  31.81 
 
 
438 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  28.9 
 
 
434 aa  186  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  33.25 
 
 
451 aa  187  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  31.48 
 
 
435 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  32.3 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  30 
 
 
428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  31.02 
 
 
438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  34.44 
 
 
436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  29.67 
 
 
434 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  29.77 
 
 
435 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  34.73 
 
 
434 aa  177  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0308812 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  28.23 
 
 
436 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  31.79 
 
 
449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  31.55 
 
 
441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  27.27 
 
 
434 aa  173  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  32.54 
 
 
436 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  30.77 
 
 
484 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  29.89 
 
 
427 aa  170  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  28.1 
 
 
448 aa  169  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  28.57 
 
 
444 aa  169  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  30.89 
 
 
469 aa  169  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  27.15 
 
 
434 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  29.53 
 
 
452 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  30.41 
 
 
438 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  27.63 
 
 
434 aa  167  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  27.4 
 
 
434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  27.4 
 
 
434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  32.87 
 
 
424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  32.39 
 
 
436 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  29.58 
 
 
488 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  26.93 
 
 
434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  26.93 
 
 
434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  26.93 
 
 
434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  26.93 
 
 
434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  28.93 
 
 
447 aa  163  6e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  28.97 
 
 
437 aa  162  8.000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  27.38 
 
 
436 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  26.93 
 
 
434 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  26.61 
 
 
430 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  26.11 
 
 
434 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  28.87 
 
 
437 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  29.52 
 
 
483 aa  160  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  31.61 
 
 
436 aa  161  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  26.22 
 
 
434 aa  160  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  30.85 
 
 
436 aa  160  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  30.85 
 
 
436 aa  160  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1010  trigger factor  31.22 
 
 
448 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595556  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  26.65 
 
 
447 aa  159  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1886  trigger factor  32.32 
 
 
449 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  27.36 
 
 
439 aa  158  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  32.84 
 
 
436 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  29.89 
 
 
434 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1537  trigger factor  32.07 
 
 
447 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  29.91 
 
 
450 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  30.3 
 
 
427 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2482  trigger factor  31.73 
 
 
449 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  28.11 
 
 
448 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>