54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1839 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  100 
 
 		 751 aa  1528    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2898  hypothetical protein  35.62 
 
 		 825 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.523858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6918  hypothetical protein  38.81 
 
 		 681 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011890  Mnod_7767  hypothetical protein  32.48 
 
 		 846 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0602  hypothetical protein  33.01 
 
 		 493 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2235  hypothetical protein  29.5 
 
 		 526 aa  172  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.215413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  28.94 
 
 		 756 aa  92.8  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18136  predicted protein  23.75 
 
 		 724 aa  89.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0028227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27548  predicted protein  23.75 
 
 		 689 aa  89.4  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000091689  normal  0.509661 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  42.06 
 
 		 695 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1690  hypothetical protein  30.69 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2163  hypothetical protein  32.2 
 
 		 189 aa  78.6  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  29.49 
 
 		 833 aa  78.6  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2965  hypothetical protein  30.86 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1907  hypothetical protein  36.8 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.27137  hitchhiker  0.000000104796 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3173  hypothetical protein  29.61 
 
 		 417 aa  73.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3564  hypothetical protein  34.23 
 
 		 734 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233058  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  41.67 
 
 		 953 aa  72  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  41.58 
 
 		 958 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  44.71 
 
 		 953 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  41.58 
 
 		 958 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1647  hypothetical protein  31.95 
 
 		 851 aa  70.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  35.17 
 
 		 770 aa  69.3  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  37.5 
 
 		 950 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  36.89 
 
 		 955 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  34.64 
 
 		 759 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  37.5 
 
 		 950 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  40.22 
 
 		 955 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0426  phage DNA-polymerase or DNA-primase  24.1 
 
 		 303 aa  62  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  36.36 
 
 		 647 aa  62  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  47.76 
 
 		 1287 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5495  Primase 2  33.91 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  32 
 
 		 774 aa  60.1  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1624  primase 2  40.48 
 
 		 309 aa  60.1  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1589  hypothetical protein  31.33 
 
 		 187 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.159507 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4210  hypothetical protein  32.14 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  35.71 
 
 		 797 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  29.69 
 
 		 857 aa  57.4  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1191  bifunctional DNA primase/polymerase  27.02 
 
 		 920 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0184938  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2915  hypothetical protein  36.49 
 
 		 765 aa  54.7  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  31.5 
 
 		 736 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5640  virulence-associated E family protein  34.95 
 
 		 761 aa  52  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000885028  normal  1 
 
 
 
NC_007412  Ava_C0063  hypothetical protein  38.89 
 
 		 332 aa  51.2  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.325511 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0468  hypothetical protein  25 
 
 		 566 aa  50.4  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2457  hypothetical protein  24.42 
 
 		 820 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3304  Primase 2  28.16 
 
 		 741 aa  48.5  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6494  Primase 2  36.9 
 
 		 621 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.921039 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1629  ATPase  26.9 
 
 		 666 aa  47  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.789736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  35.71 
 
 		 615 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  35.29 
 
 		 615 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1658  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1172 aa  46.6  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.815472  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  33.33 
 
 		 620 aa  45.8  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3313  hypothetical protein  23.7 
 
 		 444 aa  45.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0173  Primase 2  36.9 
 
 		 637 aa  43.9  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.214274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>