17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2235 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2235  hypothetical protein  100 
 
 		 526 aa  1087    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.215413  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  29.5 
 
 		 751 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0602  hypothetical protein  28.07 
 
 		 493 aa  169  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6918  hypothetical protein  32.04 
 
 		 681 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011890  Mnod_7767  hypothetical protein  27.61 
 
 		 846 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2898  hypothetical protein  28.62 
 
 		 825 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.523858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27548  predicted protein  26.22 
 
 		 689 aa  90.5  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000091689  normal  0.509661 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18136  predicted protein  25.87 
 
 		 724 aa  89.4  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0028227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  25.55 
 
 		 756 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1191  bifunctional DNA primase/polymerase  23.66 
 
 		 920 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0184938  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3313  hypothetical protein  23.96 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  24.74 
 
 		 833 aa  69.3  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0468  hypothetical protein  27 
 
 		 566 aa  68.2  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1907  hypothetical protein  30.63 
 
 		 485 aa  62  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.27137  hitchhiker  0.000000104796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5170  hypothetical protein  26.84 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196201  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2457  hypothetical protein  22.53 
 
 		 820 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  22.14 
 
 		 771 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>