14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3313 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3313  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  931    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2235  hypothetical protein  23.96 
 
 		 526 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.215413  n/a   
 
 
-
 
NC_011890  Mnod_7767  hypothetical protein  25.57 
 
 		 846 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2898  hypothetical protein  22.9 
 
 		 825 aa  59.7  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.523858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  23.88 
 
 		 833 aa  50.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1191  bifunctional DNA primase/polymerase  21.74 
 
 		 920 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0184938  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2569  virulence-associated E  22.65 
 
 		 697 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00313413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2457  hypothetical protein  23.29 
 
 		 820 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18136  predicted protein  21.39 
 
 		 724 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0028227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27548  predicted protein  21.11 
 
 		 689 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000091689  normal  0.509661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0602  hypothetical protein  21.69 
 
 		 493 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  22.39 
 
 		 756 aa  47  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0325  hypothetical protein  25.23 
 
 		 188 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.606726  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  23.7 
 
 		 751 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>