17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27548 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009368  OSTLU_27548  predicted protein  100 
 
 
689 aa  1431    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000091689  normal  0.509661 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18136  predicted protein  98.4 
 
 
724 aa  1412    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0028227  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27533  predicted protein  96.31 
 
 
423 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.413255 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28468  predicted protein  97.52 
 
 
121 aa  257  5e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.887546  hitchhiker  0.00495552 
 
 
-
 
NC_011890  Mnod_7767  hypothetical protein  25.26 
 
 
846 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2235  hypothetical protein  26.22 
 
 
526 aa  90.5  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.215413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0602  hypothetical protein  25.73 
 
 
493 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  23.75 
 
 
751 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  31.18 
 
 
756 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0468  hypothetical protein  27.16 
 
 
566 aa  81.3  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2898  hypothetical protein  26.43 
 
 
825 aa  80.9  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.523858  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  27.89 
 
 
833 aa  80.5  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6918  hypothetical protein  24.23 
 
 
681 aa  61.2  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1907  hypothetical protein  31.3 
 
 
485 aa  58.9  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.27137  hitchhiker  0.000000104796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1191  bifunctional DNA primase/polymerase  23.42 
 
 
920 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0184938  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2457  hypothetical protein  24.5 
 
 
820 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3313  hypothetical protein  21.11 
 
 
444 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>