More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0589 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  57.65 
 
 
570 aa  646    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  61.8 
 
 
572 aa  711    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  59.19 
 
 
570 aa  689    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
574 aa  1154    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  58.74 
 
 
575 aa  676    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  56.64 
 
 
585 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  60.11 
 
 
572 aa  690    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  64.07 
 
 
573 aa  707    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 
573 aa  641    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  62.85 
 
 
569 aa  745    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  56.23 
 
 
570 aa  641    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  56.23 
 
 
570 aa  641    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  67.84 
 
 
566 aa  770    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 
572 aa  652    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  58.07 
 
 
570 aa  665    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 
573 aa  640    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  56.02 
 
 
577 aa  634  1e-180  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 
570 aa  633  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  56.2 
 
 
577 aa  632  1e-180  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
579 aa  621  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 
567 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
580 aa  616  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  54.32 
 
 
574 aa  618  1e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 
576 aa  618  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0063  prolyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 
564 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.051623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 
567 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
576 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 
575 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 
566 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 
566 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 
566 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 
566 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 
566 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 
566 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
574 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 
566 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
566 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 
566 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
568 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 
566 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 
571 aa  599  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 
571 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  54.32 
 
 
574 aa  599  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 
566 aa  596  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  54 
 
 
574 aa  593  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2464  prolyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 
578 aa  588  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
570 aa  588  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
570 aa  588  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  53 
 
 
573 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1242  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
582 aa  578  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1349  prolyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 
567 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 
584 aa  578  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1323  prolyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 
567 aa  577  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
578 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 
564 aa  573  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
578 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 
569 aa  569  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 
569 aa  571  1e-161  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 
566 aa  571  1e-161  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
578 aa  571  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
578 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1699  prolyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
564 aa  568  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
578 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 
578 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
571 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
578 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
571 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 
578 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
570 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
578 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
570 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
571 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  50.44 
 
 
570 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
571 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
569 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
578 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
571 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
571 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
570 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
570 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 
571 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0830  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
567 aa  561  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0265646  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
578 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
578 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 
574 aa  559  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
578 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 
571 aa  560  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
578 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 
571 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 
571 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 
569 aa  560  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
578 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
578 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
571 aa  559  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 
571 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 
571 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
570 aa  557  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 
572 aa  556  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0686  prolyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
565 aa  557  1e-157  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.690918  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 
571 aa  555  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>