More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3314 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3314  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 356 aa  728    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.781376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.74 
 
 		 557 aa  205  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0629  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.12 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0369  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 436 aa  192  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 		 519 aa  189  8e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 		 566 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.04 
 
 		 491 aa  187  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 532 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.78 
 
 		 530 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 		 516 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2442  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.42 
 
 		 502 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 532 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 		 539 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  36.21 
 
 		 517 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3733  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.5 
 
 		 500 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  36.73 
 
 		 529 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.08 
 
 		 525 aa  180  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  36.86 
 
 		 540 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 		 519 aa  179  7e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 		 537 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 537 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 		 533 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1482  Fis family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.775538  normal  0.852697 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.99 
 
 		 502 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.54 
 
 		 502 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0836  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 		 391 aa  175  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.54 
 
 		 502 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.25 
 
 		 516 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  33.69 
 
 		 545 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 528 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 556 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3207  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 		 576 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0800  FAD dependent oxidoreductase  35.17 
 
 		 413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 		 546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.25 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 		 548 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 		 543 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1368  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.2 
 
 		 506 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1364  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.2 
 
 		 506 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3531  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.93 
 
 		 534 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.959942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.15 
 
 		 529 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0085  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.51 
 
 		 489 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.75 
 
 		 507 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 		 536 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0600  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.44 
 
 		 510 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 550 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3310  FAD dependent oxidoreductase  34.8 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.15 
 
 		 514 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  34.7 
 
 		 518 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 543 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  32.98 
 
 		 525 aa  169  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.48 
 
 		 507 aa  169  7e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2453  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.08 
 
 		 510 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.453717  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0241  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.08 
 
 		 510 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.570878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2372  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.08 
 
 		 510 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2705  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.08 
 
 		 510 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 		 524 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.81 
 
 		 510 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5335  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.39 
 
 		 504 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0816  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 396 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210853 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0740  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.81 
 
 		 510 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0726  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.08 
 
 		 510 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125098  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 522 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.38 
 
 		 509 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.889292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6005  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.18 
 
 		 507 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0493014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 		 519 aa  166  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2066  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.18 
 
 		 507 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2677  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.18 
 
 		 507 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435115  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0935  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 391 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.18 
 
 		 507 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4895  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.63 
 
 		 511 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481949  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0189  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.55 
 
 		 499 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1073  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.1 
 
 		 514 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.29 
 
 		 514 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.24 
 
 		 512 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1975  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.71 
 
 		 509 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3620  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36 
 
 		 510 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4339  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.67 
 
 		 508 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.50517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5259  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.75 
 
 		 505 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3425  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.72 
 
 		 495 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3055  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0639  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.36 
 
 		 509 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1114  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.81 
 
 		 512 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2699  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.77 
 
 		 511 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3320  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.31 
 
 		 509 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435615  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2531  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 		 391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58896  normal  0.0803699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 543 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 527 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0620  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.18 
 
 		 507 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0867  FAD dependent oxidoreductase  33.05 
 
 		 391 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4792  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.46 
 
 		 505 aa  162  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.703258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3684  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.79 
 
 		 515 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3497  FAD dependent oxidoreductase  33.43 
 
 		 391 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0200  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34 
 
 		 503 aa  162  9e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0420  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.83 
 
 		 511 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.738036 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 		 557 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.36 
 
 		 510 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>