85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3033 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3033  putative phophoslipid binding protein  100 
 
 
249 aa  500  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.435467  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1047  hypothetical protein  45.74 
 
 
184 aa  99.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202465  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  31.55 
 
 
215 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  29.26 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  31.08 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  32.34 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  27.35 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  27.56 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3925  putative phophoslipid binding protein  32.58 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.679907  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  29.28 
 
 
215 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  30.85 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  30.85 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  27.11 
 
 
220 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  29.29 
 
 
215 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  29.35 
 
 
215 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  26.82 
 
 
217 aa  62  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  28.38 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  27.93 
 
 
214 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  29.28 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  25.25 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  27.35 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  28.5 
 
 
214 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  27.36 
 
 
217 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  27.11 
 
 
215 aa  55.5  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  27.45 
 
 
217 aa  55.5  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  28.22 
 
 
215 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  27.23 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  30.61 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  28 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  26.91 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  30.18 
 
 
216 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  29.73 
 
 
215 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  29.02 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  27.23 
 
 
228 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  24.22 
 
 
217 aa  52  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  28.78 
 
 
218 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  28.76 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  27.8 
 
 
275 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  26.37 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  28.38 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  28.38 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  28.76 
 
 
215 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  28.76 
 
 
215 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  28.76 
 
 
215 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  24.88 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  28.38 
 
 
217 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4528  transport-associated protein  31.3 
 
 
159 aa  49.7  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0531104  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  27.78 
 
 
245 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  25.86 
 
 
543 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  30.63 
 
 
216 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  28.57 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  24.43 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  32.67 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1405  transport-associated protein  34.26 
 
 
184 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  29.78 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  27.47 
 
 
217 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  26.91 
 
 
282 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1441  transport-associated  33.33 
 
 
184 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  26.92 
 
 
178 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  32.67 
 
 
216 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  32.74 
 
 
181 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  27.51 
 
 
213 aa  45.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0421  transport-associated protein  25.15 
 
 
241 aa  45.4  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  28 
 
 
216 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  25.89 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  25.89 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  27.67 
 
 
217 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  27.84 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  32.41 
 
 
184 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2939  transport-associated  32.41 
 
 
184 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  26.96 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  25.22 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  25.38 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  29.27 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  24.32 
 
 
216 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  32.14 
 
 
182 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  27.67 
 
 
216 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  31.48 
 
 
181 aa  42.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  30.08 
 
 
197 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  30.08 
 
 
216 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  30.08 
 
 
216 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  30.08 
 
 
216 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  30.08 
 
 
216 aa  42  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  30.08 
 
 
216 aa  42  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3482  transport-associated  29.58 
 
 
165 aa  42  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>