More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1754 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
211 aa  420  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0088  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.53 
 
 
215 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462277  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0231  putative (homoserine/homoserine lactone) efflux transmembrane protein  51.2 
 
 
211 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0080  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.89 
 
 
215 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  45.85 
 
 
205 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  51.76 
 
 
207 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  51.18 
 
 
207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  50.59 
 
 
207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2886  LysE family protein  50.59 
 
 
207 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3088  LysE family translocator protein  50.59 
 
 
207 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3462  LysE family translocator protein  50.59 
 
 
207 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1657  LysE family protein  50.59 
 
 
207 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  44.98 
 
 
208 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3883  LysE family translocator protein  50.59 
 
 
207 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.62 
 
 
211 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.62 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.58 
 
 
207 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  40.19 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  40.67 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  37.62 
 
 
206 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  44.65 
 
 
215 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  32.04 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  36.15 
 
 
213 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  36.92 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 
211 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 
204 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.63 
 
 
208 aa  111  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 
208 aa  107  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.58 
 
 
208 aa  105  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  40.61 
 
 
213 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  38.71 
 
 
210 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
213 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 
211 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  31.65 
 
 
218 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.81 
 
 
211 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.33 
 
 
211 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
211 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
211 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  32.38 
 
 
208 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.96 
 
 
208 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.86 
 
 
216 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  29.21 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 
211 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  31.13 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1927  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.73 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 
209 aa  95.5  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  32.7 
 
 
209 aa  95.5  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.86 
 
 
219 aa  95.1  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
213 aa  95.1  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  31.28 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.87 
 
 
209 aa  94.7  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 
209 aa  94.7  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.6 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5434  lysine exporter protein LysE/YggA  34.39 
 
 
240 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.2 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  26.77 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  26.26 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.46 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 
207 aa  91.3  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  30.15 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.55 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.86 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
212 aa  90.5  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  30.15 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  36.71 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  26.77 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7111  RhtB family transporter  32.12 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  26.77 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  27.27 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  26.77 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  36.71 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  34.55 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  27.27 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  36.71 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  26.77 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02483  hypothetical protein  32.52 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  36.71 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  36.65 
 
 
242 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  36.71 
 
 
211 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  28.83 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.68 
 
 
214 aa  89.4  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  28.83 
 
 
222 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  36.71 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  28.83 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  36.71 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.73 
 
 
205 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1710  lysine exporter protein LysE/YggA  34.76 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974274  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  30.29 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  30.15 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  35.4 
 
 
208 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  31.05 
 
 
218 aa  89  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>