More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1691 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  420  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  44.91 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 217 aa  171  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.78 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.04 
 
 		 244 aa  168  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.13 
 
 		 224 aa  167  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 217 aa  167  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.13 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 212 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 215 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  40.76 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.71 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.51 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 219 aa  158  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 216 aa  157  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 253 aa  157  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  38.5 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.78 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.55 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  46.41 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  38.36 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.2 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2911  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 219 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  40.47 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.98 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  39.05 
 
 		 224 aa  154  6e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  39.05 
 
 		 224 aa  154  6e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 215 aa  154  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  40.38 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 237 aa  154  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 215 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.81 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 215 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  41.29 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 215 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.64 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.62 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  40 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2685  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  40.93 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2343  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 211 aa  151  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999882  normal  0.0841394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 219 aa  151  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  38.57 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  40.28 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  40.37 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  39.13 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.45 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  40.29 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 237 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.81 
 
 		 228 aa  149  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.36 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  38.86 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  38.65 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>