33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3385 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  100 
 
 
558 aa  1119    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  67.88 
 
 
589 aa  749    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  38.02 
 
 
978 aa  206  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  39.84 
 
 
1015 aa  199  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  38.59 
 
 
408 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  35.66 
 
 
377 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  34.17 
 
 
559 aa  151  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  32.9 
 
 
425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  31.67 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.27 
 
 
397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  31.76 
 
 
526 aa  128  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  29.66 
 
 
515 aa  123  9e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  29.89 
 
 
674 aa  122  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  28.65 
 
 
388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  31.35 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  29.46 
 
 
949 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  32.8 
 
 
391 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.81 
 
 
523 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.14 
 
 
472 aa  96.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  27.25 
 
 
399 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  27.15 
 
 
419 aa  91.7  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.18 
 
 
549 aa  90.5  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  27.44 
 
 
509 aa  87.4  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  30.95 
 
 
1173 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  28.88 
 
 
421 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  26.46 
 
 
694 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  29.54 
 
 
367 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  27.78 
 
 
652 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  26.46 
 
 
543 aa  73.9  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  27.31 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  27.31 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  26.25 
 
 
816 aa  53.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1381  neuraminidase  27.67 
 
 
807 aa  49.7  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>