More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1467 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  100 
 
 
207 aa  421  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  85.71 
 
 
204 aa  363  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  58.33 
 
 
211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  56.35 
 
 
205 aa  223  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  55.17 
 
 
210 aa  222  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1502  methyltransferase small  57.21 
 
 
202 aa  221  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0750839  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  51.92 
 
 
217 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0163  16S RNA G1207 methylase  51.17 
 
 
218 aa  211  7.999999999999999e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  51.28 
 
 
228 aa  203  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0582  methyltransferase small domain protein  48.54 
 
 
232 aa  201  6e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.719477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  52.45 
 
 
201 aa  201  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4283  methyltransferase small  52.45 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2437  methyltransferase small  56.06 
 
 
203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5504  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  50.76 
 
 
209 aa  193  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0852168  normal  0.0738737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3870  methyltransferase small  48.31 
 
 
205 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1050  methyltransferase small  47.76 
 
 
225 aa  185  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.157378 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10590  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  52.02 
 
 
204 aa  185  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.898272  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17520  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  48.44 
 
 
227 aa  182  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.249472  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  48.98 
 
 
203 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  45.23 
 
 
200 aa  173  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  44.39 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  45.85 
 
 
205 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  38.46 
 
 
199 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  38.46 
 
 
199 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  38.46 
 
 
199 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  38.46 
 
 
199 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  38.46 
 
 
199 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  38.46 
 
 
199 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  38.46 
 
 
199 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  36.78 
 
 
199 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  38.46 
 
 
199 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  37.87 
 
 
199 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  33.66 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  33.66 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0102  methyltransferase small  31.19 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  34.48 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  32.04 
 
 
202 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  32.34 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0095  methyltransferase small  33.83 
 
 
199 aa  109  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000227182  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  31.84 
 
 
198 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  32.32 
 
 
200 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  34.01 
 
 
227 aa  105  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  32.32 
 
 
200 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  35.88 
 
 
199 aa  101  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  31.31 
 
 
200 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  31.4 
 
 
201 aa  98.2  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  30.65 
 
 
196 aa  95.9  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  33.74 
 
 
196 aa  95.9  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  36.36 
 
 
186 aa  94.7  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  29.89 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2367  methyltransferase small  36.43 
 
 
205 aa  91.7  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  33.15 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2883  methyltransferase small  37.86 
 
 
195 aa  88.6  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  29.31 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  28.04 
 
 
206 aa  85.9  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  30.54 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0213  methyltransferase small  34.62 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1502  methyltransferase small  28.64 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1414  16S RNA G1207 methylase RsmC  27 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185312  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  28.74 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  31.82 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0553  methyltransferase small  34.48 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0322683  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1751  methyltransferase small  31.46 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.760844  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  26.44 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0056  methyltransferase small  29.66 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.612359  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1130  methyltransferase small  31.06 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157552  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0058  methyltransferase small  33.33 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  32.72 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3753  methyltransferase small  30.43 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0210542  unclonable  0.0000136364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0986  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.12 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1146  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  33.77 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0047  hypothetical protein  28.17 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.23937  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2551  methyltransferase small  33.15 
 
 
308 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.473932  normal  0.100873 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0188  methyltransferase small  26.18 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.15 
 
 
342 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.15 
 
 
342 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.15 
 
 
342 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.15 
 
 
342 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0055  methyltransferase small  26.76 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2276  methyltransferase small  32.58 
 
 
312 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0384491 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  30.15 
 
 
342 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  29.41 
 
 
343 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  27.95 
 
 
343 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.95 
 
 
343 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  39.47 
 
 
322 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3686  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  28.67 
 
 
343 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00016948 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  27.95 
 
 
343 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  28.67 
 
 
343 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3230  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  26.74 
 
 
342 aa  62.4  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  43.96 
 
 
284 aa  62.4  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  36.61 
 
 
315 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2178  methyltransferase small  30.15 
 
 
390 aa  62.4  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  35.97 
 
 
317 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  29.41 
 
 
342 aa  61.6  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0761  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.53 
 
 
332 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2234  methyltransferase small  32.04 
 
 
308 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0803  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.53 
 
 
332 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0789  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.53 
 
 
332 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0830  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  33.04 
 
 
347 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4605  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  27.97 
 
 
343 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000649874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>