More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1005 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1005  PfkB domain protein  100 
 
 
320 aa  631  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3279  PfkB domain protein  65.91 
 
 
321 aa  350  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07150  sugar kinase, ribokinase  55.48 
 
 
313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.218801  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  35.25 
 
 
312 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  31.58 
 
 
313 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  35.06 
 
 
306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  33.23 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.59 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  34.41 
 
 
306 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  34.54 
 
 
309 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  32.1 
 
 
308 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  33.94 
 
 
310 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  33.55 
 
 
320 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  29.92 
 
 
317 aa  99.4  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  33 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  26.81 
 
 
314 aa  97.1  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  32.66 
 
 
308 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  32.38 
 
 
314 aa  95.5  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  32.32 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  30.65 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  31.7 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.16 
 
 
322 aa  93.2  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  32.66 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  31.75 
 
 
312 aa  89.4  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  32.33 
 
 
308 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.29 
 
 
311 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.7 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  31.35 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  31.6 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.29 
 
 
307 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  32.25 
 
 
320 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  25.9 
 
 
313 aa  87  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  31.96 
 
 
326 aa  87  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  28.12 
 
 
312 aa  86.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  32.13 
 
 
308 aa  86.3  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  32.13 
 
 
308 aa  86.3  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  30.66 
 
 
301 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.64 
 
 
296 aa  85.9  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  33.22 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  30.29 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  27.1 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  30.82 
 
 
307 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  28.81 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  30.31 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  27.41 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.05 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  31.05 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  25.73 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  30.86 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  30.86 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  31.14 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  30.33 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  31.05 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  31.05 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  29.26 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.4 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  24.68 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  30.72 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  28.77 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  27.04 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  27.16 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  28.57 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  30.19 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  30.55 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  33.22 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  28.06 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.06 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  31.17 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  25.36 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  26.64 
 
 
345 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.36 
 
 
295 aa  77  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  29.74 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.56 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  27.66 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  32.89 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  32.89 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  26.43 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.27 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.27 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  29.74 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.55 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  28.57 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  30.07 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  29.1 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  28.11 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  28.36 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  27.24 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  27.13 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.39 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.24 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  27.24 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  27.24 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  29.61 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  28.47 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.24 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.24 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0873  PfkB family kinase  30.58 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>