More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0735 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.55 
 
 
536 aa  882    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
530 aa  1025    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.83 
 
 
530 aa  512  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.41 
 
 
526 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.41 
 
 
526 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.41 
 
 
526 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.24 
 
 
526 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2838  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.76 
 
 
531 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.29 
 
 
526 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43356  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.59 
 
 
527 aa  481  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1349  iron(III) ABC transporter, permease protein  54.79 
 
 
528 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2711  iron(III)-transport system permease  54.98 
 
 
528 aa  478  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0924971  normal  0.0430816 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.16 
 
 
525 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.97 
 
 
536 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.53 
 
 
528 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6135  ABC transporter membrane spanning protein  54.37 
 
 
513 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.74 
 
 
527 aa  462  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.83 
 
 
525 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.905105  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.36 
 
 
533 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.97601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.4 
 
 
518 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.543872  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.96 
 
 
509 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.94 
 
 
500 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.81 
 
 
522 aa  378  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.83 
 
 
534 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  43.98 
 
 
534 aa  333  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.46 
 
 
521 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.79 
 
 
521 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.46 
 
 
521 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3949  ABC Fe3+ transporter, inner membrane subunit  46.79 
 
 
532 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305187  normal  0.0483056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
521 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  42.35 
 
 
512 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0530  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.96 
 
 
521 aa  300  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.77 
 
 
503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8129  iron ABC transporter, permease protein  41.85 
 
 
502 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.04 
 
 
511 aa  270  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269197  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
530 aa  269  7e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.92 
 
 
514 aa  264  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923953  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06270  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  40.08 
 
 
515 aa  263  6e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0952696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.73 
 
 
515 aa  256  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000100634  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.44 
 
 
511 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
528 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
536 aa  233  8.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
523 aa  230  5e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
543 aa  210  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
541 aa  209  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
530 aa  200  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.5168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
557 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
536 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  33.88 
 
 
1057 aa  173  6.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 
540 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
530 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.442605 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
545 aa  151  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00163  putative ABC-type transport system, permease component  33.84 
 
 
507 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.452019  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.73 
 
 
550 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.11 
 
 
559 aa  127  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  24.42 
 
 
533 aa  127  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.16 
 
 
567 aa  123  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  28.09 
 
 
553 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.35 
 
 
568 aa  120  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  30.83 
 
 
538 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.17 
 
 
562 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.9 
 
 
557 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  30.48 
 
 
529 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.22 
 
 
543 aa  114  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1136  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  23.28 
 
 
532 aa  113  8.000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1525  ABC transporter, permease protein  24.15 
 
 
526 aa  110  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  25.61 
 
 
564 aa  109  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
540 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
540 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.09 
 
 
589 aa  107  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.59 
 
 
538 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.42 
 
 
561 aa  106  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.36 
 
 
549 aa  106  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.54 
 
 
550 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0167  iron ABC transporter, permease protein  22.93 
 
 
538 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.471521  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.7 
 
 
563 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0210  iron ABC transporter, permease protein  23.14 
 
 
538 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.912172  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
556 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0188  iron ABC transporter, permease protein  22.93 
 
 
538 aa  104  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.35 
 
 
562 aa  104  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.71 
 
 
545 aa  104  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
540 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0972  ABC transporter, permease protein  23.85 
 
 
521 aa  103  9e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.200041  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  30.27 
 
 
538 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.9 
 
 
558 aa  103  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0921183  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.96 
 
 
554 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.9 
 
 
528 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0116  iron ABC transporter, permease protein  24.09 
 
 
518 aa  101  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.89 
 
 
557 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.406299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2023  putative ABC transporter permease component  27.44 
 
 
559 aa  100  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967123  normal  0.0816083 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  28.25 
 
 
557 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.75 
 
 
551 aa  100  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.15 
 
 
555 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
562 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.65 
 
 
550 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.19 
 
 
553 aa  98.6  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.445803 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0490  putative iron ABC transporter  26.54 
 
 
512 aa  97.4  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.643  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05531  putative iron ABC transporter  25.28 
 
 
512 aa  97.4  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.103607  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05161  putative iron ABC transporter  25.92 
 
 
461 aa  97.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>