More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0461 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0461  Dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 231 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  61.88 
 
 		 224 aa  288  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  60.99 
 
 		 224 aa  284  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  60.54 
 
 		 224 aa  281  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  43.78 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  43.81 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.81 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  43.07 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  41.95 
 
 		 246 aa  161  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  37.79 
 
 		 237 aa  158  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  37.79 
 
 		 237 aa  158  8e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  37.79 
 
 		 237 aa  158  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31280  hypothetical protein  42.86 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  46.47 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  38.46 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  38.25 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  37.79 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  38.71 
 
 		 227 aa  154  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4023  Dimethylmenaquinone methyltransferase  44.27 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0575059 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  37.5 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  39.37 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1361  hypothetical protein  43 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  37.33 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.41 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.71 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.41 
 
 		 211 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0329  hypothetical protein  42.59 
 
 		 244 aa  141  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5179  hypothetical protein  41.57 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  38.25 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3204  hypothetical protein  40.19 
 
 		 238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.699518  normal  0.0338051 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.71 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2514  hypothetical protein  40.19 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2027  hypothetical protein  38.46 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0986  hypothetical protein  38.71 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  36.28 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3942  hypothetical protein  38.07 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  39.59 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.88 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4375  hypothetical protein  43.15 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0876  hypothetical protein  41.89 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41177  normal  0.375435 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.55 
 
 		 232 aa  128  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03235  hypothetical protein  38.75 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  39.76 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  40.36 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2677  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.69 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.19975  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6374  hypothetical protein  41.03 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0543151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.18 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4205  hypothetical protein  41.38 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5004  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40.96 
 
 		 219 aa  118  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.22 
 
 		 229 aa  114  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4781  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.93 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0200  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.36 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.59 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  29.6 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  35.88 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.64 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.02 
 
 		 204 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.64 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.64 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.96 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.23 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  30.05 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.36 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.36 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.36 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.38 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3170  demethylmenaquinone methyltransferase  34.72 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685896  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.66 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3908  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.2 
 
 		 203 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  30.65 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  31.03 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2021  dimethylmenaquinone methyltransferase  32.56 
 
 		 207 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  31.36 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.75 
 
 		 231 aa  95.1  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  28.51 
 
 		 233 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.91 
 
 		 232 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4928  Dimethylmenaquinone methyltransferase  36.75 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17069  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.03 
 
 		 450 aa  91.7  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  27.52 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.13 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  27.72 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  30.9 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0590  dimethylmenaquinone methyltransferase  35.47 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246427  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  29.44 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1224  Dimethylmenaquinone methyltransferase  30.43 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  27.45 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  31.29 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  85.1  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4868  hypothetical protein  29.72 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  30.77 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.15 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00687  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.81 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  31.84 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  28.77 
 
 		 437 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  28.07 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  29.77 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.37 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  29.63 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>