70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1963 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1963  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 343 aa  671    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2541  sodium/calcium exchanger membrane region  53.41 
 
 		 336 aa  309  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.164372  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1664  sodium/calcium exchanger membrane region  50.88 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2952  sodium/calcium exchanger membrane region  50.88 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.234735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  35.71 
 
 		 328 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  35.83 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3053  sodium/calcium exchanger membrane region  37.58 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  34.45 
 
 		 335 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2364  sodium/calcium exchanger membrane region  31.69 
 
 		 335 aa  166  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000667432  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1471  sodium/calcium exchanger membrane region  34.51 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2086  sodium/calcium exchanger membrane region  30.56 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  34.63 
 
 		 336 aa  157  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4366  sodium/calcium exchanger membrane region  34.06 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  30.72 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3173  sodium/calcium exchanger membrane region  32.33 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  33.24 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  32.45 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  32.45 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  31.23 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0802  Ca2+/H+ antiporter  31.6 
 
 		 333 aa  126  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  28.96 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3848  sodium/calcium exchanger membrane region  32.6 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2041  sodium/calcium exchanger membrane region  31.32 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.562882  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  32.67 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3347  sodium/calcium exchanger membrane region  28.78 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0089  sodium/calcium antiporter  34.02 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.770977 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  32.65 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0106  sodium/calcium exchanger membrane region  25.88 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000029721  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1978  sodium/calcium exchanger membrane region  26.81 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175474  normal  0.656987 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2364  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.34 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000100727  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.06 
 
 		 310 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  21.9 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.34 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.99 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1539  inner membrane protein  31.11 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.544691  normal  0.292097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20130  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  21.74 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0488  sodium/calcium exchanger membrane region  23.24 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.23848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0568  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  20.07 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.74342  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.17 
 
 		 311 aa  49.7  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1252  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.02 
 
 		 314 aa  49.3  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924358  normal  0.0329197 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  18.66 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06241  CaCA family sodium/calcium exchanger  20.42 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  25 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.74 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.56 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2556  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  30.4 
 
 		 309 aa  46.6  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00317334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1317  sodium/calcium exchanger membrane region  20.35 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0716  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.66 
 
 		 330 aa  46.2  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0181  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.08 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00253398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.26 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  19.7 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  19.7 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1041  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  28.72 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1188  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.43 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0590  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  30.14 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05941  CaCA family sodium/calcium exchanger  19.37 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  19.7 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  19.7 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0788  sodium/calcium exchanger membrane region  31.33 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.09 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0633  sodium/calcium exchanger membrane region  29.6 
 
 		 406 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  30.26 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.23 
 
 		 325 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  20.07 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  19.34 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2638  putative sodium/calcium exchanger  22.43 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0205  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.8 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.638827  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0203  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.8 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.42407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.29 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0004  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  21.51 
 
 		 364 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>