More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1217 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1217  integrase family protein  100 
 
 		 355 aa  720    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0758946  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0993  integrase family protein  32.32 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00576914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  27.55 
 
 		 301 aa  90.1  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  25.27 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  26.92 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  27.53 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  27.63 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  26.38 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  25.26 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  25.26 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  29.05 
 
 		 290 aa  69.3  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  31.54 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  27.88 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  30.6 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  29.3 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  26.97 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  27.65 
 
 		 300 aa  67  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  27.92 
 
 		 295 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  29.61 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  26.19 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  26.19 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  25.77 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  23.76 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  29.86 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  25.42 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  27.83 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  24.16 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  26.64 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.27 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.27 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  30.29 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1554  integrase family protein  28.81 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  decreased coverage  0.00111318 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  33.33 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  33.33 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3738  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase, phage integrase family  23.86 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000543556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  28.22 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3569  phage integrase family protein  23.95 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0892176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  30.31 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.27 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.27 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.27 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.27 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1683  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.27 
 
 		 296 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.27 
 
 		 296 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.27 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  26.71 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  25.42 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  25.43 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  23.29 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  24.41 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  27.54 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.11 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  27.54 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  23.97 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  23.63 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  25.7 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  26.56 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  27.54 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  27.84 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.57 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1189  integrase family protein  23.87 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1162  integrase family protein  23.87 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  26.69 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  23.89 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  25.93 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  28.38 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.04 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.19 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  27.3 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  23.29 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  24.46 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  32.16 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  24.43 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  23.81 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0118  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0914  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0911  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  27.43 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  22.64 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0369  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1067  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2013  integrase family protein  23.87 
 
 		 287 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000617639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  31.06 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2736  integrase family protein  23.87 
 
 		 287 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0269003  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0669  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2504  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  24.03 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  24.77 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  28.31 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.75 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  24.05 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  24.11 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  27.53 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  23.92 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  23.69 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  24.83 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>