More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4467 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  656    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  65.41 
 
 		 316 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  58.36 
 
 		 329 aa  398  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  59.29 
 
 		 330 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5792  hypothetical protein  49.66 
 
 		 326 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4082  hypothetical protein  51.89 
 
 		 291 aa  298  9e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  39.27 
 
 		 343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  37.12 
 
 		 332 aa  198  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  36.72 
 
 		 327 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  34.69 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  36.56 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  38.31 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0286  hypothetical protein  35.71 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  36.67 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  35.95 
 
 		 355 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  35.35 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5978  hypothetical protein  39.1 
 
 		 327 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665972  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1766  twin-arginine translocation pathway signal  39.02 
 
 		 338 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  35.8 
 
 		 698 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  35.96 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  34.35 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5624  hypothetical protein  35.46 
 
 		 321 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  38.37 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  34.3 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  36.08 
 
 		 328 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1838  hypothetical protein  35.56 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  34.97 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3194  hypothetical protein  35.81 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195792  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.56 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  35.23 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  36.67 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  34.88 
 
 		 333 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  33.96 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  34.62 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4265  hypothetical protein  35.96 
 
 		 328 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  36.05 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  33.56 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  35.38 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  33.13 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0164  hypothetical protein  38.01 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  35.39 
 
 		 366 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  36.63 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  33.22 
 
 		 322 aa  176  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  34.67 
 
 		 322 aa  176  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  35.27 
 
 		 348 aa  175  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  37.97 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4275  extra-cytoplasmic solute receptor  36.33 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  33.77 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  33.45 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  34.48 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  35.42 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  35.84 
 
 		 331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1769  hypothetical protein  29.9 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416782  normal  0.417571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  33.54 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  35.49 
 
 		 329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  33.23 
 
 		 331 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  34.86 
 
 		 335 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  38.1 
 
 		 329 aa  172  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4540  hypothetical protein  36.42 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  35.27 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5514  hypothetical protein  34.01 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  31.31 
 
 		 324 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  33.55 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  34.93 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  34.19 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  33.45 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  31.74 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  34.11 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0971  twin-arginine translocation pathway signal  33.13 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.694014  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  32.99 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  34.29 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  32.76 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.59 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  33.33 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  31.63 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  33.56 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  33.77 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  34.45 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  33.56 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  31.29 
 
 		 355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  31.74 
 
 		 335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  32.54 
 
 		 324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  36.54 
 
 		 335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  32.4 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  32.65 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  31.29 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0125  hypothetical protein  31.38 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0590  hypothetical protein  35.03 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  35.74 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  34.78 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  35.74 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  33.11 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  35.4 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  31.56 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  32.4 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  34.25 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  32.54 
 
 		 351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>