More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3518 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3518  histidine kinase  100 
 
 
364 aa  738    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2123  histidine kinase  42.2 
 
 
373 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1997  histidine kinase  42.32 
 
 
371 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.337155  normal  0.0103218 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4368  histidine kinase  40.97 
 
 
373 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5936  histidine kinase  40.32 
 
 
373 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6438  histidine kinase  41.13 
 
 
373 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6991  histidine kinase  37.9 
 
 
376 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306116  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4439  sensor histidine kinase  38.1 
 
 
376 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4896  sensor histidine kinase  37.23 
 
 
376 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2988  histidine kinase  38.48 
 
 
380 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.539821  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1918  sensor histidine kinase  36.34 
 
 
377 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0579  histidine kinase  35.81 
 
 
375 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3968  sensor histidine kinase  36.54 
 
 
372 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838601  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3149  histidine kinase  36.07 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.458506  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2279  histidine kinase  35.01 
 
 
447 aa  189  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2123  sensor histidine kinase  34.41 
 
 
306 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
557 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0278  histidine kinase  34.08 
 
 
405 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0030  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
460 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292632  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3228  histidine kinase  36.24 
 
 
387 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0256  histidine kinase  34.08 
 
 
405 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0267  histidine kinase  34.08 
 
 
405 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0278  histidine kinase  33.63 
 
 
471 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.182643 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2321  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
396 aa  116  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.988363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
392 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287383  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3774  PAS  30.97 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195933  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
621 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3993  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.967169  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
618 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3183  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
442 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319198  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
595 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6441  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
375 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.152019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  29.46 
 
 
728 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  29.46 
 
 
728 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  30.74 
 
 
396 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
734 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1605  sensory box histidine kinase  30.53 
 
 
391 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3583  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
397 aa  102  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3912  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
912 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237166  normal  0.236216 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2452  histidine kinase  30.93 
 
 
366 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0832  histidine kinase  26.45 
 
 
383 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.636786  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03779  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  27.38 
 
 
410 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.601764  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
375 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.745377  normal  0.599724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0619  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
379 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0923552  normal  0.109315 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0650  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
382 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
405 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364137  hitchhiker  0.00137418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5176  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
570 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1740  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
377 aa  99.4  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129887 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5387  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
375 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0971839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2762  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
373 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2993  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
393 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 
781 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 
680 aa  96.7  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1538  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
394 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461461  normal  0.397408 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0629  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
382 aa  94.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.67365  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4726  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
368 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5450  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
799 aa  93.2  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754974 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4207  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
370 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3773  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.19 
 
 
394 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719874  normal  0.310272 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1000  histidine kinase  24.84 
 
 
385 aa  92.8  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.146298  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1473  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
1084 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
708 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0792  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
592 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.389456  hitchhiker  0.00398352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2070  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
613 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
456 aa  91.3  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1870  histidine kinase  32.87 
 
 
462 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.302467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
461 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00764508  normal  0.232997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 
882 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
768 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
768 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1606  sensor histidine kinase  35.06 
 
 
403 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2823  histidine kinase  31.36 
 
 
501 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 
654 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
1501 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
1330 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
770 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  32.54 
 
 
502 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.96 
 
 
1808 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
768 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  29.26 
 
 
1222 aa  86.7  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 
730 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
768 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
1029 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3287  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
584 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847642  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3541  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
495 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 
1184 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2980  histidine kinase  36.16 
 
 
209 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0761961  normal  0.0124572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 
1331 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  32.16 
 
 
742 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 
1431 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0535  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1623  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
865 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
720 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0095  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 
582 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2395  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.532876  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
535 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
535 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  29.31 
 
 
771 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>