More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5176 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5176  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 570 aa  1161    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  48.3 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1606  sensor histidine kinase  47.01 
 
 		 403 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2321  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.988363 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3773  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  46.23 
 
 		 394 aa  332  8e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719874  normal  0.310272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2762  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 		 373 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 		 405 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364137  hitchhiker  0.00137418 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03779  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  38.42 
 
 		 410 aa  301  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.601764  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3583  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 		 397 aa  300  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5747  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 417 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00131351  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03623  sensor histidine kinase  36.39 
 
 		 414 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2174  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 413 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2158  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 414 aa  227  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0791  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 415 aa  226  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0619  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 379 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0923552  normal  0.109315 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6441  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.05 
 
 		 375 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.152019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3622  PAS sensor protein  54.76 
 
 		 684 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.76 
 
 		 684 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4515  diguanylate cyclase  47.06 
 
 		 363 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3263  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.16 
 
 		 368 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2858  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.16 
 
 		 368 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0640037  hitchhiker  0.00351788 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  44.3 
 
 		 533 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1396  diguanylate cyclase  44.65 
 
 		 356 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4430  GAF sensor hybrid histidine kinase  46.26 
 
 		 571 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2333  hypothetical protein  41.36 
 
 		 565 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2478  hypothetical protein  41.36 
 
 		 299 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  46.45 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 621 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0689  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.74 
 
 		 356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0650  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 382 aa  146  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2742  sensory box histidine kinase  52.89 
 
 		 363 aa  146  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.507187  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4542  GAF domain protein  42.58 
 
 		 166 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.78 
 
 		 1022 aa  143  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 595 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 618 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4219  hypothetical protein  41.94 
 
 		 166 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0629  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 382 aa  140  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.67365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1538  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461461  normal  0.397408 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0256  histidine kinase  37.61 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2123  sensor histidine kinase  37.67 
 
 		 306 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0030  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 460 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0278  histidine kinase  36.82 
 
 		 405 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 392 aa  137  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287383  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3149  histidine kinase  37.84 
 
 		 383 aa  137  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.458506  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5936  histidine kinase  37.17 
 
 		 373 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1918  sensor histidine kinase  36.77 
 
 		 377 aa  136  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166178 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0267  histidine kinase  36.82 
 
 		 405 aa  136  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0278  histidine kinase  35.92 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.182643 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4368  histidine kinase  35.77 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  33.71 
 
 		 728 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2988  histidine kinase  37.79 
 
 		 380 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.539821  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3912  GAF domain protein  43.92 
 
 		 170 aa  131  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.200638  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6438  histidine kinase  36.73 
 
 		 373 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 557 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3620  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3532  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2123  histidine kinase  36.73 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 564 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  33.08 
 
 		 728 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1997  histidine kinase  36.73 
 
 		 371 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.337155  normal  0.0103218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4877  PAS sensor protein  41.01 
 
 		 643 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5362  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 		 643 aa  128  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5418  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 774 aa  127  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  32.95 
 
 		 586 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4246  GAF domain-containing protein  43.17 
 
 		 202 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 734 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3993  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.967169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3968  sensor histidine kinase  38.53 
 
 		 372 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838601  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4726  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 368 aa  123  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3922  putative GAF sensor protein  40.76 
 
 		 172 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3629  GAF domain-containing protein  40.91 
 
 		 265 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.49 
 
 		 531 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2279  histidine kinase  34.8 
 
 		 447 aa  117  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1605  sensory box histidine kinase  31.94 
 
 		 391 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747269  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 421 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6991  histidine kinase  32.68 
 
 		 376 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 456 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5387  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0971839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4896  sensor histidine kinase  31.53 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 874 aa  115  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 375 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.745377  normal  0.599724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3228  histidine kinase  34.75 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0579  histidine kinase  33.33 
 
 		 375 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 597 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4439  sensor histidine kinase  31.53 
 
 		 376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3912  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 912 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237166  normal  0.236216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3518  histidine kinase  34.38 
 
 		 364 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0832  histidine kinase  33.48 
 
 		 383 aa  112  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.636786  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2993  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 393 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3774  PAS  30.8 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195933  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 610 aa  110  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2235  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 716 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530022  normal  0.014643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2395  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 384 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.532876  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2114  ATP-binding region ATPase domain protein  24.68 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 511 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2980  histidine kinase  39.66 
 
 		 209 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0761961  normal  0.0124572 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 620 aa  108  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10590  sensory histidine protein kinase  31.95 
 
 		 488 aa  108  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0489  histidine kinase  30.36 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>