23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3912 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3912  GAF domain protein  100 
 
 		 170 aa  338  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.200638  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3629  GAF domain-containing protein  78.24 
 
 		 265 aa  265  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3922  putative GAF sensor protein  78.24 
 
 		 172 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4246  GAF domain-containing protein  61.9 
 
 		 202 aa  164  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4430  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.1 
 
 		 571 aa  155  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1396  diguanylate cyclase  45.51 
 
 		 356 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  43.23 
 
 		 533 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4515  diguanylate cyclase  44.23 
 
 		 363 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  48.89 
 
 		 384 aa  133  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.59 
 
 		 1022 aa  133  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2333  hypothetical protein  40.54 
 
 		 565 aa  131  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5176  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.5 
 
 		 570 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2478  hypothetical protein  41.38 
 
 		 299 aa  127  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3263  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.69 
 
 		 368 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2858  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.69 
 
 		 368 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0640037  hitchhiker  0.00351788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0689  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.18 
 
 		 356 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2742  sensory box histidine kinase  49.15 
 
 		 363 aa  120  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.507187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3620  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 		 401 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3532  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.37 
 
 		 401 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 1013 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2704  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.56 
 
 		 494 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0570321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2797  diguanylate cyclase  30.56 
 
 		 494 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129294  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2890  diguanylate cyclase  30.56 
 
 		 494 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>