More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0629 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0629  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
382 aa  771    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.67365  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0650  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  98.69 
 
 
382 aa  758    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3993  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  65.09 
 
 
390 aa  490  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.967169  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  64.82 
 
 
392 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287383  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1740  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.8 
 
 
377 aa  315  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 
375 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.745377  normal  0.599724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5387  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 
375 aa  308  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0971839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4207  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 
370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2145  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
408 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2109  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.62 
 
 
408 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2802  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 
406 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3758  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 
408 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2005  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 
408 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.343751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0172  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
395 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2715  sensor histidine kinase/response regulator  38.82 
 
 
393 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2448  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.72 
 
 
393 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.760608  hitchhiker  0.00120668 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1070  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 
402 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.86399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
404 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5356  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 
377 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.940445 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9098  bacteriophytochrome protein  40.67 
 
 
378 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384054  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2590  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.413696 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  35.23 
 
 
544 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 
587 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  31.07 
 
 
528 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
396 aa  179  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4249  ATP-binding region ATPase domain protein  29.11 
 
 
374 aa  176  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6238  histidine kinase  36.06 
 
 
519 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547868  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  54.94 
 
 
507 aa  173  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 
557 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0278  histidine kinase  42.56 
 
 
471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.182643 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3693  histidine kinase  31.11 
 
 
667 aa  166  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3228  histidine kinase  40.34 
 
 
387 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0324  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
424 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.046409  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
1691 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6438  histidine kinase  41.55 
 
 
373 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 
572 aa  156  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5936  histidine kinase  40.18 
 
 
373 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2260  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
361 aa  155  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0019  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  55.63 
 
 
341 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0416556  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3355  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 
405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0579  histidine kinase  37.93 
 
 
375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0286  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0030  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 
460 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292632  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 
621 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
734 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4781  signal transduction histidine kinase  50.29 
 
 
356 aa  143  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3912  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
912 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237166  normal  0.236216 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4896  sensor histidine kinase  35.57 
 
 
376 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4726  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
368 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2123  histidine kinase  35.71 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4439  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
376 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
595 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
373 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0256  histidine kinase  40.27 
 
 
405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1997  histidine kinase  35.84 
 
 
371 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.337155  normal  0.0103218 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 
383 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
618 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0975  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
383 aa  139  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0278  histidine kinase  40.27 
 
 
405 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5255  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  51.43 
 
 
707 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.864356  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 
363 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0267  histidine kinase  40.27 
 
 
405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1964  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 
427 aa  137  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  normal  0.092514 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3722  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.58 
 
 
727 aa  137  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2279  histidine kinase  40.72 
 
 
447 aa  136  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5008  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.3 
 
 
708 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100946  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1645  hypothetical protein  50.72 
 
 
344 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2123  sensor histidine kinase  37.5 
 
 
306 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1538  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461461  normal  0.397408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1918  sensor histidine kinase  34.29 
 
 
377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1029  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
371 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.040723  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4959  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.8 
 
 
708 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714982  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4368  histidine kinase  37.84 
 
 
373 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0619  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0923552  normal  0.109315 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4832  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.71 
 
 
708 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2855  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6991  histidine kinase  34.87 
 
 
376 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306116  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  35.53 
 
 
396 aa  129  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1870  histidine kinase  40.25 
 
 
462 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.302467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2235  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.9 
 
 
716 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530022  normal  0.014643 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2321  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.988363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364137  hitchhiker  0.00137418 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2262  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.146487 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.09 
 
 
712 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2762  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0507  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  53.39 
 
 
706 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
387 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3583  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
397 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.36 
 
 
712 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5014  response regulator/sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  45.22 
 
 
719 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
712 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.6651  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3968  sensor histidine kinase  34.84 
 
 
372 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838601  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1606  sensor histidine kinase  35.8 
 
 
403 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1941  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
395 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0596409  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0509  PAS:GGDEF  46.9 
 
 
719 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
406 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2452  histidine kinase  31.21 
 
 
366 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
1003 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>