More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2321 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2321  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 396 aa  810    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.988363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  48.33 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3773  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  47.75 
 
 		 394 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719874  normal  0.310272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1606  sensor histidine kinase  45.69 
 
 		 403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5176  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 		 570 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.19 
 
 		 405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364137  hitchhiker  0.00137418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2762  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  43.05 
 
 		 373 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3583  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 397 aa  293  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03779  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  38.56 
 
 		 410 aa  278  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.601764  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0619  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.12 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0923552  normal  0.109315 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03623  sensor histidine kinase  36.62 
 
 		 414 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5747  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 417 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00131351  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6441  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.9 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.152019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2158  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 414 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0791  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3622  PAS sensor protein  51.9 
 
 		 684 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.63 
 
 		 684 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2174  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 413 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287383  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 621 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5936  histidine kinase  34.52 
 
 		 373 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0256  histidine kinase  38.36 
 
 		 405 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0278  histidine kinase  34.2 
 
 		 405 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  37.18 
 
 		 728 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3774  PAS  34.98 
 
 		 395 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195933  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 595 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6438  histidine kinase  34.52 
 
 		 373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0267  histidine kinase  33.83 
 
 		 405 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 618 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4368  histidine kinase  34.54 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  36.75 
 
 		 728 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1605  sensory box histidine kinase  35.36 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747269  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0650  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1997  histidine kinase  34.14 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.337155  normal  0.0103218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2123  sensor histidine kinase  34.25 
 
 		 306 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424772  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4896  sensor histidine kinase  33.46 
 
 		 376 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0278  histidine kinase  36.73 
 
 		 471 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.182643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4439  sensor histidine kinase  35.04 
 
 		 376 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2123  histidine kinase  33.21 
 
 		 373 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 557 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3149  histidine kinase  35.15 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.458506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1918  sensor histidine kinase  35.23 
 
 		 377 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2988  histidine kinase  33.06 
 
 		 380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.539821  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0629  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.67365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0030  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 460 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4542  GAF domain protein  40 
 
 		 166 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4726  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3183  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3993  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 390 aa  126  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.967169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3968  sensor histidine kinase  34.82 
 
 		 372 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838601  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6991  histidine kinase  33.47 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1538  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 394 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461461  normal  0.397408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4219  hypothetical protein  41.67 
 
 		 166 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 734 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0290  histidine kinase  33.82 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3228  histidine kinase  38.26 
 
 		 387 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5418  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.97 
 
 		 774 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3518  histidine kinase  33.06 
 
 		 364 aa  116  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1473  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 1084 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2993  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 393 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2279  histidine kinase  34.62 
 
 		 447 aa  110  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0579  histidine kinase  29.76 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2395  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.532876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 461 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00764508  normal  0.232997 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 		 579 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 		 1419 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2483  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 		 1045 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 815 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4877  PAS sensor protein  39.31 
 
 		 643 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3912  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 912 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237166  normal  0.236216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4207  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 370 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1000  histidine kinase  30.28 
 
 		 385 aa  103  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.146298  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0832  histidine kinase  31.58 
 
 		 383 aa  102  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.636786  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 535 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  31.47 
 
 		 867 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  29.24 
 
 		 535 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 535 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 535 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1870  histidine kinase  34.84 
 
 		 462 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302467 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 760 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  32.03 
 
 		 742 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 		 730 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 464 aa  99.8  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.73 
 
 		 531 aa  99.4  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1440  histidine kinase  28.27 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  30.26 
 
 		 910 aa  99.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  32.27 
 
 		 586 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 682 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320004  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2980  histidine kinase  34.9 
 
 		 209 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0761961  normal  0.0124572 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  31.11 
 
 		 746 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5387  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0971839 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 1171 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5362  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 643 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 447 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  31.63 
 
 		 897 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  25.15 
 
 		 1274 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  30.04 
 
 		 427 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>