More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2788 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
230 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2507  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.75 
 
 
238 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415229  normal  0.0198269 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 
229 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 
231 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1617  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 
229 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
233 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143238  normal  0.918847 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2089  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
238 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425137  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.712696  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2391  oxidoreductase-like  30.43 
 
 
206 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.569722  hitchhiker  0.00384612 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  31.86 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
295 aa  72  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.76 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  30.09 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  30.89 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.07 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0563281  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.89 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.239273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  31.96 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.95 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476786  normal  0.058074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2359  short chain dehydrogenase  27.43 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.53 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1820  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.15 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3702  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.24 
 
 
243 aa  65.1  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.71 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00806787 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.97 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.31881  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 
238 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.21 
 
 
249 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311099  normal  0.357873 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  29.63 
 
 
276 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 
288 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 
276 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 
274 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.11 
 
 
279 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 
274 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  29.22 
 
 
287 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.21 
 
 
259 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0150364  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 
274 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  33.67 
 
 
285 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 
287 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  30.15 
 
 
277 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1049  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.21 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.43 
 
 
280 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3961  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.16 
 
 
236 aa  63.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 
277 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.63 
 
 
238 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  26.8 
 
 
275 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1089  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.49 
 
 
244 aa  62.4  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.319271  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06941  short-chain dehydrogenase/reductase  22.18 
 
 
237 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.492424  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 
273 aa  62  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.46 
 
 
242 aa  62  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10962  short chain dehydrogenase  30.42 
 
 
253 aa  62  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.247015 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17071  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily  26.43 
 
 
236 aa  62  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.267297 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12080  short-chain alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 
266 aa  62  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  29.6 
 
 
272 aa  62  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
282 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0072  short-chain dehydrogenase/reductase  23.44 
 
 
237 aa  61.6  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.23 
 
 
266 aa  61.6  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.77 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0425184  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1259  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.05 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2093  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  24.31 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.034658  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  27.88 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  29.65 
 
 
277 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  28.65 
 
 
277 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  29.65 
 
 
277 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164626 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2488  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  24.31 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000275641  hitchhiker  0.0000923684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.94 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.012898 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0895  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.67 
 
 
245 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0373369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.5 
 
 
296 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.11 
 
 
284 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3390  short chain dehydrogenase  27.66 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4881  short chain dehydrogenase  26.43 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.968651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0676  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931099  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3129  short chain dehydrogenase  27.66 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25540  short-chain alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
281 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3270  short chain dehydrogenase  27.13 
 
 
226 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.8 
 
 
239 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
292 aa  59.7  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1872  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.83 
 
 
241 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.105262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.44 
 
 
535 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.61705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
292 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 
273 aa  59.7  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
276 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 
276 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  30.15 
 
 
286 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  29.52 
 
 
284 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>