96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0156 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 70 aa  144  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  82.46 
 
 		 76 aa  100  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4254  phage transcriptional regulator, AlpA  58 
 
 		 62 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631275  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  53.33 
 
 		 73 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  54 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  56.6 
 
 		 56 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2531  phage transcriptional regulator, AlpA  51.67 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  hitchhiker  0.000129846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15570  hypothetical protein  51.67 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000408648  unclonable  2.14199e-22 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  45.71 
 
 		 72 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  56.86 
 
 		 57 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  45.71 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  57.69 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  53.7 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  54.39 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0094  DNA binding domain-containing protein  48.53 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0288586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0630  DNA binding domain protein, excisionase family  49.12 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  49.12 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  53.06 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1172  phage transcriptional regulator, AlpA  45.61 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  49.02 
 
 		 180 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  49.02 
 
 		 180 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  49.02 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6047  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  44.44 
 
 		 380 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1575  DNA binding domain-containing protein  45 
 
 		 293 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.410844  hitchhiker  0.00561125 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  38.18 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0344  DNA binding domain-containing protein  43.64 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433328  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4099  DNA binding domain-containing protein  43.64 
 
 		 301 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00105408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4129  DNA binding domain-containing protein  43.64 
 
 		 301 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000950861  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  32.79 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0240  DNA binding domain protein, excisionase family  43.64 
 
 		 301 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.256207  hitchhiker  0.000155098 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4217  DNA binding domain-containing protein  43.64 
 
 		 301 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00203903  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0052  DNA binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 301 aa  52  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1079  DNA-binding protein/PTS system, IIA component  50 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3909  DNA binding domain-containing protein  41.82 
 
 		 301 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4502  hypothetical protein  41.82 
 
 		 301 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3713  DNA binding domain-containing protein  41.82 
 
 		 301 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.017295  normal  0.392744 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3784  DNA binding domain-containing protein  41.82 
 
 		 301 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000134193  normal  0.867769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4820  DNA binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 301 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3620  hypothetical protein  47.83 
 
 		 302 aa  51.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4428  DNA binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 301 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  41.82 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1174  phage transcriptional regulator, AlpA  35 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1468  excisionase/Xis, DNA-binding  29.09 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118441  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1001  DNA-binding excisionase/Xis  47.92 
 
 		 290 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4144  DNA binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 301 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2438  DNA binding domain-containing protein  40.43 
 
 		 291 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2133  DNA binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 252 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1062  DNA binding domain protein, excisionase family  47.92 
 
 		 291 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  33.93 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0194  DNA binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 303 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.741486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1059  DNA binding domain protein, excisionase family  47.92 
 
 		 292 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  30.77 
 
 		 70 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7292  DNA binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137944  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  31.15 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  35.59 
 
 		 84 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1683  DNA binding domain protein, excisionase family  35.85 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.629523  decreased coverage  0.0000560234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  35.85 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3844  phage transcriptional regulator, AlpA  37.1 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.279149 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3717  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 307 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.222458  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1738  DNA binding domain-containing protein  39.58 
 
 		 272 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5502  DNA binding domain-containing protein  38.3 
 
 		 291 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0554  phage transcriptional regulator, AlpA  29.51 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1226  DNA binding domain-containing protein  37.25 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  32.69 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01890  DNA-binding protein, excisionase family  39.66 
 
 		 321 aa  44.3  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0766202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1908  excisionase/Xis, DNA-binding  34.62 
 
 		 307 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0369  DNA binding domain-containing protein  30.51 
 
 		 308 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000403691  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  35.19 
 
 		 248 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  40.38 
 
 		 308 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2705  DNA binding domain protein, excisionase family  40.35 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1463  excisionase  26.98 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00572875  normal  0.0821258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  36.73 
 
 		 317 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3991  phage transcriptional regulator, AlpA  37.7 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  34.43 
 
 		 206 aa  42.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0783  DNA binding domain protein, excisionase family  46.81 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  36.54 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0119  excisionase/Xis, DNA-binding  34.69 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0674  molybdate-binding domain-containing protein  29.69 
 
 		 304 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.95042e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5334  DNA binding domain protein, excisionase family  30.77 
 
 		 124 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.329966 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  39.13 
 
 		 66 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 78 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  32.08 
 
 		 70 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  28.85 
 
 		 676 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  30.19 
 
 		 84 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  39.13 
 
 		 77 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  38.3 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2264  DNA binding domain protein, excisionase family  29.41 
 
 		 328 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4125  MerR family regulatory protein  41.18 
 
 		 51 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  38.18 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  39.13 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  42.22 
 
 		 306 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0629  periplasmic substrate-binding protein  39.29 
 
 		 290 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1532  DNA binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 201 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000035753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>