163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3620 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3620  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  622  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3713  DNA binding domain-containing protein  78.6 
 
 
301 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.017295  normal  0.392744 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3784  DNA binding domain-containing protein  78.26 
 
 
301 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000134193  normal  0.867769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3909  DNA binding domain-containing protein  78.26 
 
 
301 aa  494  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007474  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0344  DNA binding domain-containing protein  78.6 
 
 
301 aa  495  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433328  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4502  hypothetical protein  78.26 
 
 
301 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4129  DNA binding domain-containing protein  78.26 
 
 
301 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000950861  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0240  DNA binding domain protein, excisionase family  78.26 
 
 
301 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.256207  hitchhiker  0.000155098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4099  DNA binding domain-containing protein  78.26 
 
 
301 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00105408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4217  DNA binding domain-containing protein  78.26 
 
 
301 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00203903  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0052  DNA binding domain-containing protein  73.91 
 
 
301 aa  477  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4428  DNA binding domain-containing protein  72.24 
 
 
301 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4144  DNA binding domain-containing protein  71.91 
 
 
301 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4820  DNA binding domain-containing protein  71.57 
 
 
301 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1908  excisionase/Xis, DNA-binding  47.24 
 
 
307 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3717  DNA binding domain protein, excisionase family  43.92 
 
 
307 aa  242  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.222458  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0369  DNA binding domain-containing protein  31.73 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000403691  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0674  molybdate-binding domain-containing protein  30.77 
 
 
304 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.95042e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0194  DNA binding domain-containing protein  31.17 
 
 
303 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.741486  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2745  DNA binding domain-containing protein  31.08 
 
 
300 aa  123  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0629  periplasmic substrate-binding protein  32.77 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0119  excisionase/Xis, DNA-binding  29.24 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0048  DNA binding domain-containing protein  29.77 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5502  DNA binding domain-containing protein  30.17 
 
 
291 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3033  excisionase/Xis, DNA-binding  29.39 
 
 
304 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.627333  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0333  DNA binding domain protein, excisionase family  29.57 
 
 
296 aa  109  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2438  DNA binding domain-containing protein  30.72 
 
 
291 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2264  DNA binding domain protein, excisionase family  28.35 
 
 
328 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.37 
 
 
639 aa  87.4  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0616  molybdate metabolism transcriptional regulator  32 
 
 
365 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588457  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1894  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  29.41 
 
 
640 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.116253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1164  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  28.45 
 
 
655 aa  82.8  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811833  hitchhiker  0.00369459 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  26.78 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0339  molybdate metabolism transcriptional regulator  30.57 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1676  molybdenum cofactor synthesis domain protein  24.05 
 
 
633 aa  80.5  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0552  molybdate metabolism transcriptional regulator  32.02 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1772  molybdenum cofactor synthesis domain protein  25.77 
 
 
649 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0447  molybdenum cofactor synthesis domain protein  28.82 
 
 
642 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.583292  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0881  molybdenum cofactor synthesis domain protein  26.2 
 
 
624 aa  77  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.542033  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0555  molybdate metabolism transcriptional regulator  28.21 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1034  molybdate metabolism transcriptional regulator  28.21 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1054  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  29.13 
 
 
651 aa  75.5  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.39347  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0993  molybdate metabolism transcriptional regulator  28.21 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0233787  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3707  periplasmic-binding protein  29.19 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.775197 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4147  molybdate metabolism transcriptional regulator  27.84 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.70321  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3020  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  26.84 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475131  normal  0.0124041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0967  molybdate metabolism transcriptional regulator  26.32 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930984  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4308  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  29.61 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  28.45 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0920  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  28.69 
 
 
644 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0353995  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  26.67 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0730  molybdate metabolism transcriptional regulator  27.47 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.739883 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0898  molybdate metabolism transcriptional regulator  26.8 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1453  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  29.74 
 
 
652 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  28.22 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0910  molybdate metabolism transcriptional regulator  26.8 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527444  normal  0.0178578 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2363  molybdate metabolism transcriptional regulator  28.12 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1391  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  25.21 
 
 
635 aa  70.5  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0382  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  25.76 
 
 
650 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.690457  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2110  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  29.36 
 
 
649 aa  69.7  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0934426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1861  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  27.47 
 
 
647 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.72567 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3228  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  25.42 
 
 
666 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1625  molybdate transport repressor  26.67 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0664  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  25.74 
 
 
621 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.509419  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1821  putative molybdate-binding protein  28.1 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0684  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  26.86 
 
 
648 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0374  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  22.7 
 
 
632 aa  67.8  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.858069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1797  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  29.58 
 
 
655 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.984095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3787  transcriptional regulator, LysR family  27.04 
 
 
358 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2591  molybdate transport repressor  29.87 
 
 
359 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0963  molybdate transport repressor  29.87 
 
 
359 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2898  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
359 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392199  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2960  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
359 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0184  molybdate transport repressor  29.87 
 
 
359 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0083  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  26.42 
 
 
655 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.536917  normal  0.152284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0210  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  27.09 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0446  molybdate transport repressor  29.87 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3008  regulatory protein  29.87 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  26.83 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1124  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  24.44 
 
 
668 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.352674  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3479  regulatory protein LysR  26.53 
 
 
373 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  21.55 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  19.17 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  19.17 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  19.17 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  18.85 
 
 
315 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  22.15 
 
 
305 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0405  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  27.85 
 
 
636 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1699  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  25.62 
 
 
616 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.128773  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24590  molybdenum cofactor synthesis domain protein  25.42 
 
 
645 aa  61.6  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  18.85 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  18.85 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  18.53 
 
 
315 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  18.85 
 
 
315 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0615  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  25.75 
 
 
651 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2878  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  27.73 
 
 
644 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1757  molybdate metabolism transcriptional regulator  31.88 
 
 
371 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1796  molybdate-binding domain-containing protein  26.18 
 
 
289 aa  59.7  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1822  molybdate metabolism transcriptional regulator  28.45 
 
 
386 aa  58.9  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00250223 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4072  helix-turn-helix domain protein  23.28 
 
 
380 aa  59.3  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>