32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7292 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7292  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 76 aa  150  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137944  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  40.38 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 180 aa  50.4  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 180 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 180 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  40.82 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4254  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631275  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  37.25 
 
 		 89 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  42.86 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  38 
 
 		 56 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  32.73 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  35.85 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  32.73 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0630  DNA binding domain protein, excisionase family  35.85 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  30.91 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0602  DNA binding domain protein, excisionase family  36 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1683  DNA binding domain protein, excisionase family  36 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.629523  decreased coverage  0.0000560234 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2531  phage transcriptional regulator, AlpA  36 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  hitchhiker  0.000129846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15570  hypothetical protein  36 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000408648  unclonable  2.14199e-22 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1172  phage transcriptional regulator, AlpA  32.08 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  34.69 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  34.69 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  32 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  34.69 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  35.85 
 
 		 82 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0085  DNA binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0754203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1200  excisionase/Xis, DNA-binding  39.13 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000791415  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  33.96 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6047  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  37.25 
 
 		 380 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  25.53 
 
 		 74 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>