36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0602 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0602  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 147 aa  292  9e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  43.75 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0085  DNA binding domain-containing protein  52.08 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0754203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  42.11 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1059  DNA binding domain protein, excisionase family  39.06 
 
 		 292 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1468  excisionase/Xis, DNA-binding  43.4 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118441  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1001  DNA-binding excisionase/Xis  39.29 
 
 		 290 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  44.68 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  42.55 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1575  DNA binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 293 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.410844  hitchhiker  0.00561125 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1062  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 291 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  34.55 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0991  DNA binding domain protein, excisionase family  39.29 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.153101  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  35.42 
 
 		 180 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 180 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  43.59 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  35.42 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7292  DNA binding domain-containing protein  36 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137944  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  32.31 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1826  DNA binding domain protein, excisionase family  44.68 
 
 		 254 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0533  DNA binding domain, excisionase family  41.07 
 
 		 61 aa  43.5  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  32 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  32.14 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  33.96 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0094  DNA binding domain-containing protein  32 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0288586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4254  phage transcriptional regulator, AlpA  30.77 
 
 		 62 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  32.76 
 
 		 67 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 57 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3209  DNA binding domain protein, excisionase family  35.14 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  32.76 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  29.31 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  39.13 
 
 		 676 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  35.42 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3717  DNA binding domain protein, excisionase family  38.3 
 
 		 307 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.222458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>