51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3209 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3209  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
150 aa  292  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  44 
 
 
126 aa  57  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  43.75 
 
 
139 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0602  DNA binding domain protein, excisionase family  36.73 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15570  hypothetical protein  41.51 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000408648  unclonable  2.14199e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2531  phage transcriptional regulator, AlpA  41.51 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  hitchhiker  0.000129846 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  42.55 
 
 
57 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  39.58 
 
 
73 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  42 
 
 
56 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  36.73 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1575  DNA binding domain-containing protein  45.1 
 
 
293 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.410844  hitchhiker  0.00561125 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  40.82 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  34.69 
 
 
60 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  39.58 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1001  DNA-binding excisionase/Xis  45.83 
 
 
290 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1059  DNA binding domain protein, excisionase family  45.83 
 
 
292 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  38.6 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  41.3 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  39.62 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  31.03 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4254  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 
62 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631275  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  31.46 
 
 
90 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  39.62 
 
 
67 aa  43.5  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  39.62 
 
 
67 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  43.48 
 
 
85 aa  42.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  39.13 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1062  DNA binding domain protein, excisionase family  45.65 
 
 
291 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  32.2 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  30 
 
 
287 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4125  MerR family regulatory protein  43.18 
 
 
51 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  41.51 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  39.22 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  41.18 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  39.22 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  39.22 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  40.43 
 
 
78 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  39.13 
 
 
74 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0085  DNA binding domain-containing protein  35.85 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0754203  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  48.94 
 
 
371 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1200  excisionase/Xis, DNA-binding  37.74 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000791415  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  29.63 
 
 
180 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  39.13 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  29.63 
 
 
180 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  29.63 
 
 
180 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6047  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  42.55 
 
 
380 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1738  DNA binding domain-containing protein  39.13 
 
 
272 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0893  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  41.3 
 
 
230 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7292  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137944  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  36.73 
 
 
69 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.317776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>