More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2468 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  100 
 
 
470 aa  931    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  60.54 
 
 
467 aa  496  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  59.81 
 
 
434 aa  491  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  54.67 
 
 
451 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  57.78 
 
 
449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  55.12 
 
 
462 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  53.06 
 
 
410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  53.3 
 
 
410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  53.06 
 
 
410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  53.3 
 
 
410 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  52.71 
 
 
411 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  52.81 
 
 
410 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  53.06 
 
 
410 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  54.02 
 
 
457 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  52.81 
 
 
410 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  52.83 
 
 
410 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  55.24 
 
 
461 aa  443  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  54.57 
 
 
405 aa  420  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  52.94 
 
 
472 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  47.9 
 
 
406 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  53.58 
 
 
405 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  50.47 
 
 
515 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  50.23 
 
 
515 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  49.77 
 
 
488 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  52.97 
 
 
402 aa  395  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  49.65 
 
 
489 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  54.05 
 
 
402 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  49.44 
 
 
464 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  50.12 
 
 
496 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  51.59 
 
 
408 aa  387  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  51.59 
 
 
408 aa  386  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  50.47 
 
 
463 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  55.06 
 
 
401 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  51.85 
 
 
408 aa  385  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  48.85 
 
 
438 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  48.85 
 
 
438 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  49.07 
 
 
507 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  49.14 
 
 
428 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  50.37 
 
 
431 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  49.55 
 
 
444 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  48.83 
 
 
485 aa  382  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  49.88 
 
 
459 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  49.4 
 
 
466 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  49.02 
 
 
427 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  49.4 
 
 
500 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  49.4 
 
 
466 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  51.92 
 
 
466 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  49.4 
 
 
466 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  49.4 
 
 
500 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  50.99 
 
 
411 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  49.4 
 
 
444 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  49.4 
 
 
478 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  50.72 
 
 
423 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  49.16 
 
 
469 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  49.14 
 
 
429 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  53.33 
 
 
402 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  48.31 
 
 
501 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  49.38 
 
 
402 aa  374  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  47.96 
 
 
500 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  47.65 
 
 
429 aa  369  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  48.44 
 
 
500 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  48.44 
 
 
500 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  48.44 
 
 
500 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  51.61 
 
 
397 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  49.66 
 
 
433 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  48.79 
 
 
504 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  49.88 
 
 
502 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  49.5 
 
 
397 aa  366  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  49.64 
 
 
499 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  46.43 
 
 
467 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  47.29 
 
 
433 aa  365  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  49.51 
 
 
453 aa  360  3e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  47.76 
 
 
398 aa  360  4e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  46.85 
 
 
436 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  45.31 
 
 
431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  48.34 
 
 
470 aa  356  5e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  49.32 
 
 
445 aa  356  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  48.77 
 
 
453 aa  356  5e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0588  ammonium transporter  45.34 
 
 
435 aa  355  1e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2140  ammonium transporter  49.63 
 
 
438 aa  355  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  50.85 
 
 
413 aa  354  2e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06675  ammonium transporter  46.97 
 
 
427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  48.14 
 
 
400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3314  ammonium transporter  49.88 
 
 
442 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  46.78 
 
 
399 aa  352  8e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  48.66 
 
 
433 aa  351  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  46.24 
 
 
462 aa  349  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  46.37 
 
 
432 aa  348  9e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  47.01 
 
 
398 aa  348  1e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  47.53 
 
 
439 aa  348  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  47.14 
 
 
431 aa  348  1e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  48.2 
 
 
497 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  49.14 
 
 
401 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  45.58 
 
 
438 aa  347  2e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  48.2 
 
 
503 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  48.17 
 
 
455 aa  347  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2342  ammonium transporter  47.11 
 
 
455 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.602093 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  46.68 
 
 
434 aa  347  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0292  ammonium transporter  44.64 
 
 
500 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  47.69 
 
 
477 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.63779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>