34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_05281 on replicon BN001305
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05281  conserved hypothetical protein  100 
 
 
601 aa  1256    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.185294  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3529  Pyranose oxidase  28.05 
 
 
498 aa  176  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0214681 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0134  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase  22.3 
 
 
480 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  31.69 
 
 
571 aa  63.9  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  21.8 
 
 
522 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  21.8 
 
 
522 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  22.13 
 
 
522 aa  57.8  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2585  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.57 
 
 
554 aa  54.7  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129064  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.88 
 
 
545 aa  53.9  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3766  GMC oxidoreductase  28.99 
 
 
582 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  23.26 
 
 
528 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.67 
 
 
522 aa  52  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.6 
 
 
534 aa  51.6  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2390  GMC oxidoreductase  30.29 
 
 
546 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  22.28 
 
 
523 aa  49.3  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 
923 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651694  normal  0.376335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  19.9 
 
 
534 aa  48.9  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  31.72 
 
 
570 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23 
 
 
528 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  22.85 
 
 
551 aa  47.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.83 
 
 
572 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.46 
 
 
533 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.49 
 
 
527 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.19 
 
 
533 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.19 
 
 
533 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.34 
 
 
573 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.72 
 
 
533 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2465  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
581 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.08 
 
 
573 aa  44.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.23 
 
 
531 aa  44.3  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.42 
 
 
579 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2167  GMC oxidoreductase  30.22 
 
 
545 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.87 
 
 
563 aa  44.3  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  28.1 
 
 
539 aa  43.9  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0767108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>