67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1561 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1561  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0263676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1466  hypothetical protein  97.86 
 
 
280 aa  364  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0249  hypothetical protein  80 
 
 
281 aa  340  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2397  hypothetical protein  95 
 
 
280 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.32635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  34.57 
 
 
278 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  34.44 
 
 
271 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  34.32 
 
 
276 aa  99.4  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  47.06 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  39.01 
 
 
274 aa  92.4  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  30.58 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  37.43 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  34.19 
 
 
273 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  39.2 
 
 
274 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  35.74 
 
 
278 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 
278 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  35.74 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 
278 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  29.82 
 
 
272 aa  87  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  30.97 
 
 
275 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  38.25 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  37.99 
 
 
271 aa  82  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  37.99 
 
 
271 aa  82  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  33.69 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0697  nitrous-oxide metabolic protein NosY  30.32 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.168715  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  32.49 
 
 
275 aa  79  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  27.74 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  37.2 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  34.2 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  34.2 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  37.09 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  27.64 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  31.01 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  25.52 
 
 
281 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  32.49 
 
 
276 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  30.4 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1735  nitrous oxide reductase maturation protein NosY  34.38 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5551  hypothetical protein  24.31 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756056  hitchhiker  0.000373453 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20170  NosY protein  34.38 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702753  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  32.29 
 
 
275 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  25.61 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 
319 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  29.24 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  36.57 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1721  ABC transporter  27.16 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  30.4 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  27.61 
 
 
276 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0666  multi-copper enzyme maturation ABC-type transport system permease component  26.75 
 
 
275 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1215  hypothetical protein  29.47 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  29.66 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  26.94 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  28.35 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  30.88 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 
283 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0452  nitrous-oxide metabolic protein NosY  21.14 
 
 
255 aa  52.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101154  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  35.97 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  33.84 
 
 
332 aa  50.1  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2630  ABC-2 type transporter  33.03 
 
 
278 aa  49.3  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  33.33 
 
 
276 aa  48.9  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  29.69 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1562  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.7 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00415  normal  0.281318 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 
322 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  29.63 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>