More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0917 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0917  putative periplasmic protease  100 
 
 
312 aa  635  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0886  putative periplasmic protease  99.04 
 
 
312 aa  629  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  49.26 
 
 
348 aa  332  4e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  49.56 
 
 
348 aa  332  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  49.12 
 
 
365 aa  324  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.38973e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  51.97 
 
 
348 aa  324  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  51.97 
 
 
348 aa  322  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1707  putative periplasmic protease  50.8 
 
 
347 aa  319  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3556  putative periplasmic protease  54.9 
 
 
339 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132568  normal  0.518214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3211  putative periplasmic protease  54.97 
 
 
339 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.888582  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1913  putative periplasmic protease  54.1 
 
 
339 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.786378  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  48.32 
 
 
338 aa  315  9e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3922  putative periplasmic protease  53.77 
 
 
339 aa  314  1e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113918  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  48.01 
 
 
338 aa  313  2e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3114  putative periplasmic protease  52.48 
 
 
340 aa  312  6e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0953569  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  53.42 
 
 
337 aa  308  7e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.82338e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  51.63 
 
 
348 aa  307  1e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  51.63 
 
 
348 aa  307  1e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  51.63 
 
 
348 aa  307  1e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  52.96 
 
 
348 aa  306  2e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  2.88065e-08 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1530  putative periplasmic protease  51.3 
 
 
353 aa  305  5e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  2.85162e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1193  putative periplasmic protease  52.16 
 
 
349 aa  303  3e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  44.1 
 
 
356 aa  303  3e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2471  putative periplasmic protease  48.84 
 
 
337 aa  302  6e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.73214e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2530  putative periplasmic protease  50.3 
 
 
339 aa  298  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.322286 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  48.15 
 
 
343 aa  298  6e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2460  putative periplasmic protease  53.8 
 
 
340 aa  298  9e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0165849  hitchhiker  0.0077968 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  47.3 
 
 
336 aa  297  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1906  putative periplasmic protease  47.08 
 
 
348 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.37079e-13 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2181  putative periplasmic protease  51.01 
 
 
344 aa  296  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1612  putative periplasmic protease  47.08 
 
 
348 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17623e-10 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1430  putative periplasmic protease  47.08 
 
 
348 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.28088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1848  putative periplasmic protease  47.08 
 
 
348 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805473  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  47.49 
 
 
347 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  3.53353e-05 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1972  putative periplasmic protease  49.67 
 
 
349 aa  296  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114164  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1843  putative periplasmic protease  46.78 
 
 
348 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.383e-07 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  51.03 
 
 
347 aa  295  6e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  49.06 
 
 
338 aa  295  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.34628e-08  unclonable  7.65641e-11 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1161  putative periplasmic protease  49.19 
 
 
353 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01896  putative periplasmic protease  49.32 
 
 
340 aa  294  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000105224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  49.21 
 
 
341 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27550  putative periplasmic protease  53.38 
 
 
342 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003018  SohB protein peptidase U7 family  48.04 
 
 
353 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  9.39e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  49.21 
 
 
341 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  47.81 
 
 
338 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.01356e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0843  putative periplasmic protease  50.16 
 
 
325 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  48.12 
 
 
338 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.29962e-06  unclonable  2.62337e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  44.71 
 
 
349 aa  289  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  44.41 
 
 
349 aa  288  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.80069e-08 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  44.41 
 
 
349 aa  288  9e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  44.41 
 
 
349 aa  288  9e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  3.87336e-07 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  44.41 
 
 
349 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  44.41 
 
 
349 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2692  putative periplasmic protease  48.75 
 
 
338 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.60799e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  44.41 
 
 
349 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  1.40347e-14 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2903  putative periplasmic protease  46.46 
 
 
343 aa  286  3e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.80746e-07  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  44.12 
 
 
349 aa  286  3e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2407  putative periplasmic protease  50.99 
 
 
343 aa  286  3e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.70796e-06  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2728  peptidase, U7 family  51.82 
 
 
340 aa  286  3e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2394  putative periplasmic protease  49.38 
 
 
338 aa  284  1e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  2.16852e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1605  putative periplasmic protease  44.79 
 
 
334 aa  283  2e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  47.19 
 
 
338 aa  283  3e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  47.68 
 
 
342 aa  282  4e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  3.59076e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  56.95 
 
 
324 aa  282  6e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  48.12 
 
 
338 aa  281  9e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.1118e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2629  putative periplasmic protease  45.28 
 
 
333 aa  280  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.751964  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  56.5 
 
 
326 aa  280  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0332  putative periplasmic protease  44.44 
 
 
332 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0578  putative periplasmic protease  48.37 
 
 
353 aa  280  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.8636e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  47.81 
 
 
338 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.22492e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1674  putative periplasmic protease  49.47 
 
 
330 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  6.78362e-06  hitchhiker  0.00314277 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1897  Peptidase S49 domain protein  46.97 
 
 
347 aa  275  7e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02863  putative periplasmic protease  47.59 
 
 
353 aa  275  8e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0992  putative periplasmic protease  54.75 
 
 
332 aa  270  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0462132  unclonable  6.96502e-10 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0973  putative periplasmic protease  48.14 
 
 
334 aa  265  6e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1088  putative periplasmic protease  48.14 
 
 
334 aa  265  6e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  46.23 
 
 
335 aa  265  7e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1938  putative periplasmic protease  50.61 
 
 
349 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_4014  predicted protein  50 
 
 
216 aa  205  6e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  48.61 
 
 
234 aa  200  2e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  41.21 
 
 
165 aa  131  2e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.74 
 
 
547 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  31.84 
 
 
364 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  31.34 
 
 
364 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.15 
 
 
595 aa  93.6  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0640  peptidase S49  28.02 
 
 
265 aa  93.2  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.12 
 
 
590 aa  92.8  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  3.75913e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33 
 
 
596 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  29.82 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  29.17 
 
 
552 aa  90.9  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  31.16 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  29.65 
 
 
616 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.73 
 
 
335 aa  89.4  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  32.04 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  30.45 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.73 
 
 
625 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2523  peptidase S49  28.77 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0396  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.31 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  31.03 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.31 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.44919e-05  normal  0.445804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>