More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2849 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 143 aa  280  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  59.56 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  58.73 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  52.52 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  58.02 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  48.92 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  51.08 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  45.99 
 
 		 152 aa  113  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  45.11 
 
 		 144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  45.52 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  46.38 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 		 162 aa  100  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  46.21 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  42.75 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  41.48 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  46.49 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  42.45 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  39.26 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  42.57 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  38.98 
 
 		 173 aa  63.5  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  34.21 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  41.46 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  32.82 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  30.38 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  39.17 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  42.5 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0728  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>